Wetenschap
Uitgebreid overzicht van de belangrijke rollen en regulerende mechanismen van lncRNA's in groenten en fruit
Met de ontwikkeling van technologieën voor genoomsequencing zijn veel lange niet-coderende RNA's (lncRNA's) geïdentificeerd in groenten en fruit. Uitgebreid onderzoek naar lncRNA's heeft hun rol onthuld bij het reguleren van de expressie van eiwitcoderende genen op zowel transcriptioneel als post-transcriptioneel niveau, waardoor ze een cruciale rol spelen in de groei, ontwikkeling en stressreacties bij groenten en fruit.
Een nieuwe recensie gepubliceerd in Horticulture Research biedt een uitgebreide samenvatting van het huidige inzicht in de vorming, functionele kenmerken en regulerende mechanismen van lncRNA's in groenten en fruit.
Op basis van hun transcriptierichting en positie ten opzichte van eiwitcoderende genen worden lncRNA's ingedeeld in vier typen:intergene lncRNA's (lincRNA's), lange niet-coderende antisense-transcripten (lncNAT's), sense-lncRNA's en intronische lncRNA's (incRNA's). In dit artikel worden de vorming en de basiskenmerken van lncRNA's in groenten en fruit beschreven vanuit drie aspecten:overvloed en omvang, structuur en lokalisatie, verval en evolutie.
De rol van lncRNA's in groenten en fruit is uitgebreid samengevat en besproken in recente onderzoeksrapporten, waarin verschillende aspecten worden behandeld, waaronder pigmentophoping, ontwikkeling van voortplantingsorganen, rijping van fruit, evenals reacties op tekorten aan voedingsstoffen, zout, droogte, temperatuur en pathogene bacteriën. .
Bovendien hebben de auteurs de regulerende mechanismen van lncRNA's bij de transcriptionele regulatie van genen en alternatieve splitsing opgehelderd, evenals de interacties tussen lncRNA's en plantenhormonen, transcriptiefactoren en miRNA's.
De ontwikkeling van high-throughput sequencing-technologie heeft het vermogen om lncRNA's te ontdekken, voorspellen en identificeren aanzienlijk verbeterd. Er blijft echter een tekort aan uitgebreide lncRNA-analysegegevens in plantendatabases met betrekking tot lncRNA's in groenten en fruit, wat de karakterisering van lncRNA-expressie en lokalisatie belemmert.
Bovendien vormen de kosten die gepaard gaan met subcellulaire lokalisatie-experimenten van lncRNA's, zoals FISH, een beperking voor lncRNA-onderzoeken, wat de dringende behoefte aan de ontwikkeling van meer betaalbare methoden voor lncRNA-onderzoek benadrukt.
De verkenning van de functie en het mechanisme van lncRNA's in groenten- en fruitgewassen bevindt zich nog in de beginfase, en de snelle ontwikkeling van de technologie zal nieuwe kansen en doorbraken opleveren voor lncRNA-onderzoek in groenten en fruit.