Wetenschap
Bevindingen suggereren dat ILF3 kan functioneren als een lezer van telomere R-lussen om telomere homeostase te helpen behouden
Ontregelde R-lussen kunnen vastgelopen replicatievorken en telomeerinstabiliteit veroorzaken. Hoe R-lussen worden herkend en gereguleerd, is echter nog steeds niet goed begrepen, vooral bij telomeren.
In een nieuwe studie gebruikten onderzoekers nabijheidsafhankelijke biotine-identificatie (BioID) -technologie om het ILF3-interactoom te identificeren en ontdekten ze dat ILF3 interageert met verschillende DNA / RNA-helicasen, waaronder DHX9. Deze interactie suggereert dat ILF3 de resolutie van telomere R-lussen kan vergemakkelijken, waardoor abnormale homologe recombinatie wordt voorkomen en telomere homeostase behouden blijft.
Het werk, getiteld "ILF3 beschermt telomeren tegen afwijkende homologe recombinatie als een telomere R-loop reader", werd gepubliceerd in Protein &Cell .
De belangrijkste bevindingen uit het onderzoek zijn onder meer:
- ILF3 vertoont een selectieve interactie met telomere R-lussen, waardoor telomeren worden beschermd tegen afwijkende homologe recombinatie.
- Het functieverlies van ILF3 verhoogt bijgevolg de TERRA-niveaus, waardoor de accumulatie van R-lussen bij telomeren wordt veroorzaakt. Deze accumulatie veroorzaakt DNA-schadereactie (DDR) en telomeerdysfunctie, gekenmerkt door verhoogde TIF's, telomeerfragiliteit en de aanwezigheid van extrachromosomale telomeerfragmenten, die op hun beurt de ALT-route kunnen activeren.
- Bovendien onthulde het in kaart brengen van het ILF3-interactoom interacties met verschillende DNA/RNA-helicasen, waaronder DHX9, met een significante implicatie dat ILF3 mogelijk helpt bij het oplossen van telomere R-lussen door zijn interactie met DHX9.
- ILF3 fungeert mogelijk als lezer voor telomere R-lussen en helpt bij het voorkomen van afwijkende homologe recombinatie en het handhaven van telomere homeostase.
Deze resultaten ondersteunen dat ILF3 interageert met telomere RNA:DNA-hybride structuren zoals R-loops en de resolutie bevordert of overmatige accumulatie van R-loops door de RNA-helicase DHX9 remt.
Dit onderzoek levert nieuwe inzichten op in de regulatie van telomere R-lussen en de mechanismen die de homeostase van telomeren in stand houden, met implicaties voor de verouderingsbiologie.