Een verandering in pH van lichaamsvloeistoffen kan een diepgaand effect hebben op cellen. De optimale pH van verschillende lichaamsvloeistoffen of compartimenten varieert. Arterieel bloed heeft een pH van 7,4, intracellulair vocht een pH van 7,0 en veneus bloed en interstitiële vloeistof hebben een pH van 7,35. De pH-schaal meet waterstofionconcentraties en omdat de meting op een logschaal gebeurt, betekent een verschil van 1,0 een 10-voudig verschil in waterstofionconcentratie. Wanneer de pH in lichaamsvloeistoffen te laag wordt, begint het lichaam te lijden aan acidose en wanneer het te hoog wordt, wordt de aandoening alkalose genoemd. Acidose of alkalose kan worden veroorzaakt door ziekte of dieet.
Hersencellen

Een kleine verandering in pH in het ruggenmergvocht en hersenvocht tijdens acidose veroorzaakt een afname van de affiniteit van hemoglobine voor zuurstof, waardoor de kritieke zuurstof wordt verminderd leveren aan hersencellen. Acute acidose leidt tot lethargie en mentale verwarring. Tijdens alkalose of een stijging van de pH samentrekken de bloedvaten en verminderen daardoor de toevoer van bloed en zuurstof naar hersencellen. Alkalosis kan leiden tot verwarring, epileptische aanvallen en bewustzijnsverlies.
Immuuncellen

Wanneer de pH van bloed tijdens acidose onder 7.35 daalt, geven immuuncellen, zoals macrofagen, ontstekingscytokines af, die ontstekingen veroorzaken. Acidosis beïnvloedt ook de reactie van lymfocyten om pathogenen te bestrijden, wat resulteert in een slechte immuunrespons.
Botcellen

Acidose heeft een negatief effect op het bot, waardoor het calciumverlies toeneemt. Wanneer de pH van het bloed lager wordt dan pH 7,35, worden osteoclastcellen geactiveerd en resorberen of vernietigen ze botten. In botcelexperimenten verdubbelde een pH-daling van minder dan 0,1 de hoeveelheid bot dat door osteoclasten werd geresorbeerd. Tijdens normale botremodellering resorberen osteoclasten bot en osteoblast bouwen bot op. Een lage pH of acidose remt de botopbouwende activiteit van osteoblasten, wat bijdraagt aan het algehele botverlies. Bij een hoge pH van 7,4 of hoger wordt de osteoclastactiviteit onderdrukt.
spiercellen

Bloedacidose kan leiden tot spierverlies of -degradatie. Skelet- en hartspiercellen worden aangetast. Een lage pH vermindert de contracties van de hartspiercellen. Gladde spiercellen worden ook beïnvloed door acidose. Vasculaire gladde spiercellen trekken bijvoorbeeld samen met verhogingen van extracellulaire pH en ontspannen met verlagingen van pH. Een stijging van de extracellulaire pH verhoogt de instroom van calcium in vasculaire gladde spiercellen, terwijl een verlaging van de pH het binnendringen van calcium in cellen remt.