De moleculaire vorm van NaHCO3 is een onregelmatige tetraëder. Dit komt omdat het HCO3-ion een trigonale piramidevorm heeft en het Na+-ion zich boven een van de vlakken van de piramide bevindt. De Na-O-bindingen zijn korter dan de O-C-bindingen en de O-H-binding is de langste binding in het molecuul.