* Seagrass Meadows: Dit zijn hun primaire voedselbron, en zeekoeien spelen een cruciale rol bij het handhaven van de gezondheid van deze weiden door te grazen en ze uit te houden van overmatige plantengroei.

* Mangrove -moerassen: Manteensen gebruiken mangroven voor onderdak en bescherming tegen roofdieren, vooral tijdens koud weer.

* rivieren en kanalen: Mannentjes gaan vaak naar deze waterwegen om aan de kou te ontsnappen of om voedsel te vinden.

* kustlagunes en baaien: Deze gebieden bieden ondiepe, warme wateren die ideaal zijn voor zeekoeien.

Hoewel ze voornamelijk worden geassocieerd met deze kust- en estuarine -ecosystemen, kunnen zeekoeien ook worden gevonden in zoetwateromgevingen zoals bronnen en rivieren.