Er bestaat enige bezorgdheid dat inspanningen voor het herstel van habitats in de wildernis van Californië onbedoelde negatieve gevolgen kunnen hebben voor inheemse planten. Deze zorgen komen voort uit het feit dat herstelprojecten vaak de verwijdering van niet-inheemse planten met zich meebrengen, wat het delicate evenwicht van het ecosysteem kan verstoren en omstandigheden kan creëren die minder gunstig zijn voor inheemse planten.

Een van de grootste uitdagingen bij het herstel van habitats is het verwijderen van niet-inheemse planten zonder inheemse planten te beschadigen. Niet-inheemse planten kunnen zeer agressief zijn en kunnen inheemse planten snel overtreffen om hulpbronnen, zoals water en zonlicht. Dit kan leiden tot een afname van de inheemse plantenpopulatie en een verschuiving in de algehele plantengemeenschap.

Daarnaast kan het verwijderen van uitheemse planten de bodem ook verstoren, waardoor deze gevoeliger kan worden voor erosie. Dit kan leiden tot verdere schade aan het ecosysteem en tot verlies van waardevolle bovengrond.

Een andere zorg is dat restauratieprojecten soms nieuwe niet-inheemse planten in het ecosysteem kunnen introduceren. Dit kan gebeuren wanneer de planten die bij restauratieprojecten worden gebruikt niet inheems zijn in het gebied, of wanneer ze niet goed worden gemonitord en gecontroleerd. De introductie van nieuwe niet-inheemse planten kan een verwoestende impact hebben op de inheemse plantengemeenschap, omdat ze zich snel kunnen verspreiden en inheemse planten kunnen verdringen om hulpbronnen.

Over het geheel genomen is het belangrijk om de potentiële voordelen van habitatherstel af te wegen tegen de potentiële risico's. Hoewel herstelprojecten zeer gunstig kunnen zijn voor het milieu, is het belangrijk om stappen te ondernemen om de potentiële negatieve gevolgen voor inheemse planten tot een minimum te beperken.