Een gen voor oogkleur kan bijvoorbeeld twee allelen hebben:bruin en blauw. Iemand die homozygoot is voor bruine ogen heeft twee exemplaren van het bruine allel, terwijl iemand die heterozygoot is voor bruine en blauwe ogen één kopie van elk allel heeft.

Het genotype van een organisme is de combinatie van allelen die het voor een bepaald gen heeft. Het fenotype van een organisme zijn de waarneembare kenmerken van het organisme, die worden bepaald door het genotype en de omgeving.

In het geval van oogkleur zal een persoon die homozygoot is voor bruine ogen bruine ogen hebben, terwijl iemand die heterozygoot is voor bruine en blauwe ogen bruine of blauwe ogen zal hebben, afhankelijk van welk allel dominant is.

Allelparen zijn belangrijk omdat ze de eigenschappen bepalen die een organisme zal hebben. Ze spelen ook een rol in de evolutie, omdat ze van generatie op generatie kunnen worden doorgegeven.