science >> Wetenschap >  >> Biologie

Wetenschappers publiceren het genoom van de waterbuffel

Krediet:Universiteit van Adelaide

Een internationaal team van onderzoekers onder leiding van de Universiteit van Adelaide heeft het volledige genoom van de waterbuffel gepubliceerd, wat de weg vrijmaakt voor een betere fokkerij en instandhouding van dit economisch belangrijke dier.

Het consortium van partners in Australië, Italië, China, Brazilië, en de VS, met extra bijdragers in andere landen, zeggen dat ze nu de tools hebben gecreëerd die nodig zijn om moderne moleculaire kweeksystemen toe te passen op waterbuffels.

"Waterbuffels werden ongeveer 5000 jaar geleden gedomesticeerd, en sindsdien van economisch belang zijn geweest voor melk, vlees en als werkdier over de hele wereld, " zegt consortiumleider professor John Williams, Directeur van het Davies Research Center van de Universiteit van Adelaide op de Roseworthy-campus.

"Ze zijn vooral belangrijk in ontwikkelingslanden en, in gespecialiseerde markten, ze leveren melk voor producten zoals mozzarella kaas in Italië. De waterbuffel is een belangrijk landbouwdier omdat hij zich kan aanpassen aan verschillende omgevingen, en is bijzonder tolerant ten opzichte van ziekten.

"In Australië, ze werden in het begin van de 19e eeuw naar Northern Territory gebracht en tegenwoordig zijn er kuddes buffels in Northern Territory en in Zuid-Australië te melken."

Er zijn twee ondersoorten van waterbuffels. De onderzoekers hebben het genoom van de rivierbuffel gesequenced, die zijn geselecteerd voor melkproductie via georganiseerde fokprogramma's in Italië, Indië, de Filippijnen en Brazilië.

Professor Williams zegt dat dergelijke vooruitgang in de genomica een revolutie teweeg heeft gebracht in het fokken van melkvee en dat nu dezelfde moleculaire hulpmiddelen beschikbaar zullen zijn voor het fokken van waterbuffels. Dit project is weer een geweldig voorbeeld van de diepgang en expertise van de University of Adelaide op onderzoeksgebieden die verband houden met voedselinnovatie.

"De publicatie van het buffelgenoom vormt het essentiële referentiepunt voor studies over de moleculaire genetica van de buffel, Professor Williams zegt. "Het zal fokkers helpen om commercieel wenselijke eigenschappen in de waterbuffel te verbeteren, en onderzoekers en natuurbeschermers om de diversiteit van buffelpopulaties te behouden."

Het buffelgenoom is gepubliceerd in het tijdschrift GigaScience .

Onderzoeksmedewerker en hoofdauteur Dr. Daniela Iamartino, R&D technisch manager bij de AIA-LGS (Italian Breeder Association - Laboratory of Genetics and Services) in Italië, zegt:"Het is ook mogelijk om het genoom van buffels te vergelijken met dat van andere soorten om de verschillen in de biologie van buffels en hun vermogen om zich aan te passen aan een grote verscheidenheid aan omgevingen te begrijpen.

"De annotatie van het genoom identificeert de aanwezige genen om hun functie te onderzoeken en de verschillen tussen soorten te bestuderen, " ze zegt.

Het consortium onder leiding van professor Williams heeft ook details van een specifiek moleculair hulpmiddel (de Buffalo SNP-chip genoemd) in het tijdschrift gepubliceerd PLOS EEN . Met deze SNP-chip kunnen onderzoekers en veredelaars de genoomsequentie-informatie in de praktijk brengen. Genen die betrokken zijn bij belangrijke productie- en ziektegerelateerde eigenschappen kunnen worden gelokaliseerd en gebruikt om de fokwaarden van individuele stieren en koeien in te schatten.

"Dit biedt buffelfokkers dezelfde mogelijkheden voor versnelde genetische selectie die nu door veefokkers wordt gebruikt, ’ zegt professor Willems.