Een team van onderzoekers van de Universiteit van Californië heeft een manier gevonden om meerdere genen te synthetiseren uit een groep microarray-gegenereerde oligonucleotiden. In hun artikel gepubliceerd in het tijdschrift Wetenschap , de groep beschrijft hun techniek, genaamd DropSynth, hoe goed het werkt, en zijn nadelen.

Het synthetiseren van genen is zo populair geworden dat er nu bedrijven zijn die het voor de kost doen, maar het is nog steeds een dure aangelegenheid - de huidige methoden vereisen het naaien van kleine strengen één voor één in reeksen nadat ze zijn gemaakt. In deze nieuwe poging de onderzoekers rapporteren een eenpotsbenadering van gensynthese die tot kostenverlaging zou kunnen leiden.

Momenteel, gensynthese wordt gedaan met behulp van een microarray, produceren van DNA-oligonucleotiden, die vervolgens aan elkaar moeten worden genaaid - het team van UoC begon ook met een microarray, maar ze gaven de oligonucleotiden eerst een identificerende lengte van de gensequentie, die ze omschrijven als een 'streepjescode'. Volgende, ze voegden microbeads toe met gratis streepjescodes die overeenkomende oligonucleotiden uit een pool van verschillende soorten oligonucleotiden konden halen. Het resultaat was een pool van microbeads, die elk een kleine groep gehechte oligonucleotiden van hetzelfde type hadden. Het team sloot vervolgens elk van de microbeads (en de groep oligonucleotiden) in een emulsiedruppel met behulp van wat ze beschrijven als een vortex van een oligonucleotide en oliemengsel - gedurende 30 seconden. Daarna, enzymen zorgden ervoor dat alle oligonucleotiden in een enkele druppel samensmolten (via polymerase-cyclische assemblage), resulterend in een gewenste volgorde. De sequenties werden vervolgens uit de emulsie verwijderd, klaar voor gebruik.

Het proces is beter dan conventionele methoden, stelt het team voor, omdat het toegang biedt tot een genenpool tegen in wezen dezelfde kosten als een oligonucleotidepool - het voegt niet veel toe. Helaas, er is een vrij groot nadeel. Het proces, zij merken op, is "slordig, " omdat het slechts ongeveer 5 procent efficiënt is - lang niet goed genoeg voor gebruik in productieprocessen. Positiever is:de methode kan worden gebruikt om grote bibliotheken met genen voor verschillende doeleinden te creëren, tegen zeer geringe kosten. Het kan ook worden gebruikt bij onderzoeksinspanningen, vooral degenen die betrokken zijn bij eiwitontwerp.

© 2018 Fys.org