KFU Extreme Biology Lab en RIKEN hebben nieuwe feiten ontdekt over de groei van kippenembryo's, die tot soortgelijke ontdekkingen over mensen kunnen leiden. Het werk is gepubliceerd in PLOS Biologie .

Ruslan Devyatiyarov, junior onderzoeksmedewerker bij het KFU Extreme Biology Lab, zei, "De verkregen resultaten worden momenteel gepresenteerd als een georganiseerde database van promotors in kippenembryo's in verschillende ontwikkelingsstadia, en het gepubliceerde onderzoek is het brondocument met de annotatie en de beschrijving van de basiseigenschappen van deze promotors en de activiteit van de genen die ermee verbonden zijn."

"De CAGE-methode wordt vaak gebruikt in het FANTOM-project om het startpunt van gentranscriptie te bepalen. CAGE heeft al geholpen bij het identificeren van promotors van specifieke weefsels en cellen van mensen, muizen, drosophila en andere modelorganismen.

"Het is onmogelijk om menselijke embryo's te testen vanwege ethische richtlijnen. Daarom ontbrak het project aan gegevens over de embryonale ontwikkeling. We denken dat de gedomesticeerde kip het dichtst bij de vervangende rol past, omdat het een vruchtwaterorganisme is met een relatief conservatieve ontwikkeling.

"We hebben biologische monsters gebruikt vanaf het moment van het leggen van eieren tot het moment van uitkomen, vervolgens CAGE-bibliotheken voorbereid en de sequentie ervan bepaald. Dus, we hebben een volledige genoomannotatie gemaakt van de punten van transcriptie-initiatie in verschillende stadia van kippenembryogenese. Verder, we hebben enkele gegevens over specifieke weefsels en cellen toegevoegd, namelijk, hepatocyten, cellen van aortale niet-gestreepte spieren, mesenchym, poten en vleugels tijdens hun opkomst op de derde dag van de embryonale ontwikkeling. Onze transcriptomische gegevens kunnen worden gebruikt om de evolutie van promotors te vergelijken om de belangrijkste transcriptiefactoren te bepalen, genen of hun isovormen die bijdragen aan weefselvorming."

FANTOM houdt zich voornamelijk bezig met onderzoek naar zoogdieren, en kippen staan ​​niet centraal. Echter, na deze succesvolle try-out, de wetenschappers besloten door te gaan met het onderzoek. De grootste interesse van het team, vanwege de focus op extreme omstandigheden, is geconcentreerd op het vermogen van de kippenembryo's om de groei bij verlaagde temperaturen op te schorten. Dit winterslaapvermogen is nog niet grondig bestudeerd, en het belooft een aantal interessante praktische implicaties.

"Als een kip haar slaapplaats verlaat, embryo's stoppen met ontwikkelen totdat de temperatuur de norm bereikt. Dat is, wanneer eieren zijn afgekoeld tot 16 graden, ze gaan in winterslaap. Overwintering bij kippen, natuurlijk, is niet zo extreem als anhydrobiose, maar dit proces kan gemakkelijker zijn bij aanpassing aan menselijke weefsels en cellen. Dus, het bepalen van de belangrijkste moleculaire componenten van de regulering van dit proces is onze volgende stap", voegde de heer Devyatiyarov toe.

De database is online beschikbaar op http://fantom.gsc.riken.jp/zenbu/