Wetenschap
Krediet:Makkonen et al. J. Chem. Fys. 154, 114102 (2021)
Leden van de CEST-groep publiceerden een recent artikel waarin ze een nieuwe methode introduceerden om CD-spectra in de open source GPAW-code te berekenen. De publicatie laat zien dat de geïmplementeerde aanpak efficiënter is dan de veelgebruikte lineaire-responsmethode en gemakkelijk CD-spectra van nanoschaalsystemen kan berekenen, zoals hybride zilverclusters samengesteld uit meer dan 1000 atomen.
Het opnemen van CD-spectra is een zeer krachtige methode om de chirale optische eigenschappen te bestuderen en kleine structuurveranderingen in chirale moleculen te detecteren, DNA, eiwitten en nanoclusters, om er een paar te noemen. Echter, de computationele kosten van de veelgebruikte lineaire responstijdafhankelijke dichtheidsfunctionaaltheorie (TDDFT) -methodologie nemen drastisch toe met de systeemgrootte die wordt geobserveerd, en kan doorgaans alleen worden toegepast op kleine systemen. Om deze uitdaging te overwinnen, onderzoekers Esko Makkonen, Tuomas Rossi, Patrick Rinke en Xi Chen werkten samen met medewerkers uit Jyväskylä, Spanje en Colombia implementeren een efficiëntere aanpak op basis van realtime TDDFT om CD-spectra te berekenen. De gepubliceerde code biedt zowel lineaire combinaties van atomaire orbitalen (LCAO) als rastermodi. De LCAO-modus is gunstig voor grote systemen, terwijl de rastermodus geschikt is voor kleine moleculen en benchmarkdoeleinden, waardoor deze nieuwe methode extreem veelzijdig is.
De auteurs hebben deze nieuwe implementatie op verschillende systemen getest. In alle testgevallen de berekeningen laten een hoge efficiëntie zien en komen goed overeen met experimentele resultaten en referentieberekeningen. Gedreven door dit aanvankelijke succes, de groep is nu klaar om nog veel meer chirale nanoclusters te bestuderen. Het doel van dit werk is om de oorsprong van chirale optische eigenschappen in nanoclusters te ontdekken, en ontwerp metalen clusters die bruikbaar zijn als chirale sensoren.
Dit artikel is gepubliceerd in The Tijdschrift voor Chemische Fysica .
Wetenschap zegt:wen aan uitbraken van polaire vortexen
Hoe (en waarom) optimistisch te blijven als het voelt alsof de omgeving uit elkaar valt?
Onderzoek identificeert hotspots van schendingen van de waterkwaliteit
Nicaragua ondertekent klimaatakkoord Parijs:officieel
Soedanese hoop dat Ethiopische dam een einde maakt aan overstromingen van de Blauwe Nijl
Amerikaanse energieachterblijvers voldoen nog steeds niet aan Parijs:analyse
Hoe werkt een Crookes-radiometer?
Transcriptiefactoren en genexpressie heroverwegen
Presentatie van succesvolle STEM-prestaties van vrouwen, een sociaal vaccin tegen genderstereotypen
Techniek voor kwantificering van erytrocytenzinkprotoporfyrine IX en protoporfyrine IX
Het mysterie van bruine dwergen ontrafelen
Wetenschapsproject over hoe een ei te drijven
Tech wil problemen op hoogspanningslijnen voorspellen vóór een ramp
Wetenschap © https://nl.scienceaq.com