De tumorvasculatuur is een belangrijk doelwit van antikankertherapieën. Rieger, Fredrich en Welter aan de Universiteit van Saarland, Duitsland streeft al enkele jaren naar een kwantitatieve analyse van de fysieke determinanten van gevasculariseerde tumoren. Met behulp van computersimulaties hebben ze de kennis kunnen recapituleren die is verkregen uit in vitro onderzoek van tumorsferoïden, diermodellen en klinische studies en hebben een gevasculariseerd tumorsysteem in silico opnieuw gecreëerd.

Ze hebben onlangs tumorcode vrijgegeven, een software die verschillende bekende modellen samenvoegt tot een multischaalbenadering waarmee tumorgroei kan worden beschreven op lengteschalen die relevant zijn voor klinische toepassingen. De code en een gedetailleerde gebruikershandleiding zijn open en openbaar beschikbaar, in de hoop dat verder gebruik en verfijningen de vooruitgang en ontdekking in het veld zullen versnellen.

In deze EPJE Tips and Tricks paper De auteurs presenteren de technische aspecten volgens de workflow van een typische simulatieprocedure. Belangrijk is dat hun aanpak de studie van topologische en functionele aspecten tegelijkertijd mogelijk maakt, wat relevant is voor therapeutische behandelingen.

De broncode van de tumorcode is beschikbaar onder een open source-licentie op:https://github.com/thierry3000/tumorcode