science >> Wetenschap >  >> Biologie

Moleculaire markers onderzoeken de natuurlijke populatiestructuur en eigenschapgerelateerde loci van kiwibes

Gehalveerde vrucht van Actinidia arguta hortgem (winterharde kiwi), gewoonlijk "Baby Kiwis" of "Kiwi Berries" genoemd. Krediet:Rillke/Wikimedia Commons, CC BY

Actinidia arguta (Sieb. &Zucc.) Planch. ex Miq., ook wel kiwibes of babykiwifruit genoemd, behoort tot het geslacht Actinidia en de familie Actinidiaceae. Het onderscheidt zich van andere kiwi's door zijn kleine formaat en gladde, haarloze, groene of paars gekleurde, eetbare schil en een zoet aroma. Het is een van de meest aangeplante Actinidia-soorten in commerciële boomgaarden.

Onderzoekers van de Wuhan Botanical Garden van de Chinese Academie van Wetenschappen hebben samen met medewerkers van het New Zealand Institute for Plant and Food Research Limited en de Chinese Research Academy of Environmental Sciences de genetische diversiteit en populatiestructuur geëvalueerd met 189 toetredingen gegenotypeerd door 200 eenvoudige Sequence Repeats (SSR) markers.

Een totaal van 2.496 allelen werden geïdentificeerd uit 189 toetredingen van de zeven wilde populaties. Door analyse van de populatiestructuur konden de toetredingen worden ingedeeld in vier subgroepen, waarbij elke subgroep consistent was met de geografische afstand.

Associatieanalyse identificeerde 35 SSR-markers die significant geassocieerd waren met fruitkenmerken, zoals geslacht en vleeskleur. De marker LR71 die in dit onderzoek werd gevonden, was significant geassocieerd met kleur en gekoppeld aan een transcript dat codeert voor MYB-transcriptiefactor-eiwit.

Dit is de eerste keer dat zulke grote aantallen wilde genetische toevoegingen worden gebruikt om genetische associatie in kaart te brengen in A. arguta door middel van genomica en gentranscriptie met SSR. De resultaten zullen een substantiële bron vormen voor toekomstig begrip van de moleculaire relatie van A. arguta met andere Actinidia-soorten en door moleculaire marker-geassisteerde kweek.

De resultaten zijn gepubliceerd in Scientia Horticulturae . + Verder verkennen

Onderzoek onthult mechanisme dat ten grondslag ligt aan accumulatie van chlorogeenzuur in appels