In een stap in de richting van het overbruggen van de kloof tussen schimmeltaxonomie en moleculaire ecologie, wetenschappers van verschillende instellingen, waaronder het Los Alamos National Laboratory, hebben een monster van "mysterieuze" schimmel gekarakteriseerd dat is verzameld in North Carolina en zijn thuis heeft gevonden in de schimmelboom des levens.

"Werkende schattingen vertellen ons dat er meer dan 5 miljoen soorten schimmels zouden moeten zijn, " zei Cheryl Kuske, een Los Alamos-wetenschapper op het project. "We hebben eigenlijk alleen 100 geïdentificeerd en volledig beschreven, 000 van hen, Hoewel, en nieuwe mogelijkheden voor DNA-sequencing laten ons zien dat veel, veel exemplaren in onderzoekscollecties zijn niet gekarakteriseerd. Het oplossen van dit specifieke mysterie toont de potentiële waarde aan van het gebruik van omgevingssequencing om taxonomische en ecologische ontdekkingen te begeleiden."

Het schimmelmonster was gedeeltelijk interessant omdat het een belangrijk onderdeel van de waargenomen schimmelpopulatie in een dennenbos vertegenwoordigde en het positief reageerde op verhoogde CO2- en stikstofveranderende behandelingen die toekomstige omgevingsomstandigheden nabootsen, maar de exacte plaatsing van het monster in de taxonomische volgorde was onbekend. Het monster kreeg uiteindelijk een nieuwe naam, Bifiguratus adelaidae , zoals onlangs in het tijdschrift werd gemeld Mycologia .

Waarom was dit moeilijk? In tijden waarin een eenvoudig wanguitstrijkje met een cheque een menselijk DNA-rapport kan opleveren met duizenden voorouders, een steekproefidentificatie lijkt een eenvoudige taak. Maar zoals een hoofdartikel in het tijdschrift opmerkte, dit monster vertegenwoordigde een van de vele "donkere materie-schimmels" die onbekende gebieden van de schimmelboom des levens bevolken. We kunnen hun DNA detecteren in omgevingsmonsters, maar hun cultuur is ongrijpbaar geweest.

Zoals opgemerkt in de redactie van het tijdschrift, "Deze plaatsing is bijzonder opwindend vanwege het toegenomen begrip van de mycorrhiza-rol (het vermogen om symbiotische, nutriëntenoverdrachtsrelaties) voor dit deel van de fylogenie en het feit dat er zeer weinig bekend is over de soortendiversiteit en verspreiding in dit deel van de boom. Bifiguratus adelaidae kan een symbiotische functie hebben in wortels, aangetroffen in orchideeën- en kastanjewortels, maar het is ook goed gedocumenteerd in bodems uit noordelijke gematigde zones."

interessant, het verzamelde monster was alleen met succes in het laboratorium gekweekt als het in het gezelschap van een bacteriesoort mocht groeien, methylobacterie , dat antibiotica niet konden doden. Normaal gesproken zou het schimmelmonster van dergelijke verontreinigingen zijn ontdaan, maar deze weerstond hun pogingen. De auteurs stellen dat de aanwezigheid van de symbiotische of commensale microben een deel van het kweeksucces kan zijn. Het begrip van complexe microbiële en schimmelgemeenschappen vordert, Kuske merkte op, door organismen te laten groeien als gedefinieerde mengsels.

Los Alamos National Laboratory voert een breed scala aan biologische onderzoeksinspanningen uit als onderdeel van zijn nationale veiligheidswetenschappelijke missie, met onderzoek zoals fylogenetische analyse om veilige versus gevaarlijke pathogenen te bepalen en om ziektetransmissieroutes te identificeren.

De Bifiguratus adelaidae werd genoemd ter ere van Adelaida Chaverri Polini. Dr. Chaverri was een wereldwijd erkende tropische bioloog en rolmodel voor vrouwen in Latijns-Amerika in de wetenschap, technologie, Engineering, en wiskunde. Haar belangrijkste bijdragen waren in de studie en het behoud van tropische bergbossen en boomloze alpengraslanden (páramos). Als bioloog, ze erkende het belang van mycorrhiza-schimmels en droeg bij aan de beschrijving van een schimmel in de Acaulosporaceae , een schimmel in dezelfde stam als de soort die in dit artikel wordt beschreven. Ze steunde de oprichting van Costa Rica's National Park Service, die de basis vormen voor een uitgebreide instandhouding van de biologische diversiteit. In 2013, ze werd opgenomen in de Galería de la Mujer, een van de hoogste onderscheidingen voor Costa Ricaanse vrouwen voor hun toewijding aan het verdedigen en verbeteren van de mensenrechten van vrouwen.