Een onderzoeksgroep aan de Tohoku University heeft een belangrijke ontdekking gedaan met positieve implicaties voor de ontwikkeling van bacteriebestrijdende medicijnen. De aminoacyl-tRNA-site (A-site) van het 16S RNA-decoderende gebied in het bacteriële ribosoom ziet er veelbelovend uit voor een nieuw tijdperk van de ontwikkeling van antibiotica.

Traditionele aminoglycoside-antibiotica zijn problematisch vanwege hun hoge toxiciteit en het potentieel voor resistentieontwikkeling. Het onderzoek aan de Tohoku University richtte zich op bacteriële A-site bindende kleine liganden waarvan de structuren verschillen van de aminoglycosidefamilie, die potentieel bieden voor de ontwikkeling van nieuwe geneesmiddelen die bacteriële infecties behandelen met een vermindering van de problemen die gepaard gaan met traditionele antibiotica.

De onderzoeksgroep onder leiding van Dr. Seiichi Nishizawa en Dr. Yusuke Sato (Departement Chemie, Graduate School of Science) heeft een nieuw klein ligand gerapporteerd, ATMND-C ₂ -NH ₂ die de nauwste bindingsaffiniteit heeft voor de bacteriële A-plaats onder de niet-aminoglycosideliganden.

ATMND-C ₂ -NH ₂ vertoont een significante fluorescerende uitdovingsreactie na selectieve binding aan de interne lus van het bacteriële (Escherichia coli) A-site-bevattende model-RNA.

ATMND-C ₂ -NH ₂ is ook nuttig gebleken als indicator voor het beoordelen van interacties tussen liganden en A-plaatsen.

De resultaten van de onderzoeksgroep bieden een rationele basis voor het genereren van nieuwe A-site bindende liganden met het oog op nieuwe antibiotica met minder toxiciteit en minimale resistentieontwikkeling.