Hoewel bekend is dat Amerikaanse zeearenden verschillende diëten hebben, is er geen bewijs dat ze in aanzienlijke mate op prairiehonden jagen in de Great Plains of enige andere regio. Amerikaanse zeearenden voeden zich voornamelijk met vissen, watervogels en andere waterdieren, en hun dieetsamenstelling varieert afhankelijk van de habitat en de beschikbare voedselbronnen. Terwijl Amerikaanse zeearenden af en toe kleine zoogdieren, zoals knaagdieren, consumeren als opportunistische voeders, maken prairiehonden doorgaans geen deel uit van hun normale dieet of een primaire voedselbron.