Onderzoekers van de Monash University hebben een manier gevalideerd om met succes een breed scala aan bacteriën (pathogenen) te detecteren die diarree veroorzaken in informele nederzettingen.

Betere bescherming tegen ziekten voor mensen die leven in gemeenschappen met water, sanitaire en hygiënische uitdagingen zijn essentieel, aangezien microben die gastro-intestinale ziekten veroorzaken (enteropathogenen) verantwoordelijk zijn voor 1,4 miljoen sterfgevallen per jaar, voornamelijk bij kinderen onder de vijf jaar, en leiden tot verminderde voeding en ontwikkeling.

Echter, het is een grote uitdaging om hun verspreiding effectief te monitoren vanwege het grote aantal pathogenen en bronnen die erbij betrokken zijn. Talrijke enteropathogenen veroorzaken diarree en andere gastro-intestinale ziekten, virussen overspannen, bacteriën, amoebe, en wormen, elk met verschillende kenmerken. Bovendien, ze worden verspreid via complexe paden via menselijke, dier, milieu, en voedselbronnen. traditioneel, microbiologen controleren alleen geselecteerde pathogenen en elke bron wordt meestal afzonderlijk getest.

De studie, gepubliceerd in De Lancet Planetaire Gezondheid , voor het eerst de laboratoriummethode, de TaqMan Array Card (TAC), geëvalueerd tegen de gouden standaardmethode, standaard kwantitatieve polymerasekettingreactie (qPCR). Ze ontdekten dat de TAC sneller en goedkoper is dan qPCR, terwijl het vergelijkbaar nauwkeurige resultaten levert en tegelijkertijd meer dan 30 verschillende enteropathogenen detecteert.

Dr. Rachael Lappan, microbioloog van het Biomedicine Discovery Institute van de Monash University, leidde de vergelijkende studie met afvalwatermonsters uit Melbourne en menselijke ontlasting. dierenpoep, bodem, en watermonsters uit informele nederzettingen in Suva, Fiji. Ze zegt dat het valideren van de TAC-methode een grote stap voorwaarts is in de strijd tegen het complexe en verwaarloosde probleem van diarree bij kinderen.

'Enteropathogenen kunnen op zoveel verschillende manieren worden opgepikt in informele nederzettingen, en het kan een echte uitdaging zijn om ze te controleren, omdat er zo'n verscheidenheid aan enteropathogenen is die bijdragen aan ziekte, ' legt Dr. Lappan uit. 'TAC biedt een relatief eenvoudige en betaalbare manier om dit te doen, en het kan op elk soort monster worden gedaan.'

'Het is ongelooflijk belangrijk omdat het ons zal helpen de paden waarlangs mensen ziek worden beter te begrijpen en te monitoren, en helpen die trajecten aan te pakken met effectieve waterbeheerinterventies die uiteindelijk kunnen leiden tot een betere gezondheid, zoals degene die we testen in het programma Revitalizing Informal Settlements and their Environments (RISE), ' zei dokter Lappan.

Mede-senior auteur van het artikel, Universitair hoofddocent Chris Greening van het Biomedicine Discovery Institute van Monash University, voegt eraan toe 'door deze methoden te vergelijken, we wilden weten of het vermogen om een ​​breed scala aan enteropathogenen efficiënt te detecteren, gepaard zou gaan met een aanzienlijk nadeel in gevoeligheid. Echter, we hebben aangetoond dat TAC vergelijkbaar is met qPCR en bij uitstek geschikt is voor brede pathogene screening die niet praktisch is om uit te voeren via standaard qPCR.'

Het onderzoek is uitgevoerd als onderdeel van het programma Revitalizing Informal Settlements and their Environments (RISE), een interdisciplinair onderzoeksprogramma en proef met als doel het beheer van water en sanitatie in stedelijke informele nederzettingen met op de natuur gebaseerde infrastructuur te verbeteren. OPSTAAN, en ander transformerend water, sanitaire en hygiëneprogramma's, hebben technieken nodig die uitgebreide maar efficiënte monitoring van enteropathogenen mogelijk maken om milieuverontreiniging en ziektelast voor en na interventies te begrijpen.