* Nucleus: Dit is de meest prominente en bekende organel die DNA bevat. Het herbergt het grootste deel van het genetische materiaal van de cel in de vorm van chromosomen.

* mitochondria: Deze organellen, vaak aangeduid als de 'krachtpatsers van de cel', hebben hun eigen cirkelvormige DNA -molecuul gescheiden van het nucleaire DNA. Dit mitochondriale DNA (mtDNA) codeert voor sommige van de eiwitten die betrokken zijn bij cellulaire ademhaling.

* chloroplasten: Alleen in plantencellen gevonden, zijn deze organellen verantwoordelijk voor fotosynthese. Ze bevatten ook hun eigen cirkelvormige DNA -molecuul, bekend als chloroplast -DNA (cpDNA), dat codeert voor eiwitten die betrokken zijn bij fotosynthese en andere chloroplastfuncties.

Hoewel dit de primaire organellen zijn met hun eigen DNA, is het vermeldenswaard dat sommige andere organellen sporen van DNA kunnen hebben, maar het wordt niet als een bepalend kenmerk van deze organellen beschouwd.