Science >> Wetenschap >  >> Biologie

Wat is een standaard DNA -grootte en waarom deze wordt gebruikt in gelelektroforese?

DNA -grootte standaard in gelelektroforese

Een DNA -grootte -standaard, ook bekend als een DNA -ladder of molecuulgewichtsmarker, is een mengsel van DNA -fragmenten met bekende afmetingen. Het wordt gebruikt in gelelektroforese als referentie om de grootte van onbekende DNA -fragmenten in een monster te bepalen.

Dit is waarom het cruciaal is:

1. Groottebepaling:

* Tijdens elektroforese migreren DNA -fragmenten door de gelmatrix op basis van hun grootte. Kleinere fragmenten bewegen sneller en verder, terwijl grotere fragmenten langzamer bewegen en dichter bij de put blijven.

* Door de maatstandaard naast het monster uit te voeren, kunt u de migratieafstand van onbekende fragmenten visueel vergelijken met de bekende maten in de standaard.

* Hiermee kunt u de grootte van uw DNA -fragmenten in basisparen (BP) of kilobaseparen (KB) schatten.

2. Visualisatie en analyse:

* De grootte -standaard helpt de scheiding van DNA -fragmenten in de gel te visualiseren. Het creëert verschillende banden die overeenkomen met de bekende afmetingen en vormen een ladderachtig patroon.

* Dit patroon werkt als een visuele gids voor het analyseren van de voorbeeldbanden. U kunt eenvoudig het groottebereik van uw monsterfragmenten identificeren door hun positie te vergelijken ten opzichte van de standaard.

3. Kwaliteitscontrole:

* De standaardstandaard dient als een kwaliteitscontrolemaatregel. Het zorgt ervoor dat de gelelektroforese -run succesvol is en de scheiding van DNA -fragmenten optimaal is.

* Als de standaardbanden van de grootte niet duidelijk zijn gedefinieerd of onjuist migreren, duidt dit op potentiële problemen met de elektroforese -opstelling of voorwaarden.

4. Problemen oplossen:

* Het analyseren van de grootte -standaard kan problemen oplossen met het gelelektroforese -experiment.

* Als een monsterband bijvoorbeeld groter lijkt dan verwacht, kan dit een onvolledige spijsvertering of afbraak van het DNA suggereren.

Soorten DNA -maatstandaarden:

Er zijn verschillende soorten DNA -maatstandaarden commercieel beschikbaar, variërend in grootte en het aantal fragmenten. Ze bevatten meestal een mengsel van lineaire DNA -fragmenten met verschillende maten.

Samenvattend:

Een DNA -maatstandaard is een essentieel hulpmiddel voor gelelektroforese. Het biedt een referentie voor groottebepaling, visualisatie, kwaliteitscontrole en probleemoplossing, waardoor een nauwkeurige analyse van DNA -fragmenten in een monster mogelijk wordt.