* Reproductieve isolatie: Net als veel andere dieren hebben verschillende vleermuissoorten verschillende paringsgedrag, oproepen en fysieke kenmerken ontwikkeld. Deze verschillen fungeren als barrières voor kruising.

* genetische verschillen: Zelfs als twee soorten erin slagen om te paren, is hun DNA vaak te verschillend om levensvatbare nakomelingen te produceren. De resulterende embryo's ontwikkelen zich mogelijk niet goed of de nakomelingen kunnen onvruchtbaar zijn.

* Ecologische specialisatie: Bat -soorten hebben vaak gespecialiseerde diëten en habitats, die bijdragen aan hun reproductieve isolatie. Dit betekent dat ze elkaar misschien niet eens in het wild tegenkomen om te paren.

Er zijn echter zeldzame gevallen van hybridisatie geweest, vooral bij nauw verwante soorten. Sommige onderzoekers hebben bijvoorbeeld gevallen gedocumenteerd van kruising tussen de * myotis lucifugus * (kleine bruine vleermuis) en * myotis yumanensis * (yuma myotis). Maar deze instanties worden over het algemeen beschouwd als uitzonderingen in plaats van de regel.

Kortom, hoewel het niet onmogelijk is voor vleermuizen van verschillende soorten om te kruisen, is het zeer ongebruikelijk en resulteert het vaak in niet-levensvatbare nakomelingen.