Macronucleus :

- Primaire kern

- Verantwoordelijk voor cellulaire activiteiten, waaronder groei, voortplanting en metabolisme

- Polyploïde, dat meerdere kopieën van het genoom bevat, waardoor efficiënte genexpressie mogelijk is

- Controleert processen die nodig zijn voor celonderhoud.

- Bevat sterk geamplificeerde genen die nodig zijn voor celdeling.

- Heeft een beperkte genetische diversiteit als gevolg van frequente genherschikkingen.

Micronucleus :

- Kleinere kern, vaak gelegen nabij de macronucleus.

- Bevat een enkele kopie van het diploïde genoom

- Werkt als een kiembaankern die betrokken is bij seksuele voortplanting en genetische uitwisseling.

- Ondergaat meiose tijdens conjugatie, een seksueel proces waarbij genetisch materiaal wordt uitgewisseld.

- Het garandeert genetische diversiteit en vergemakkelijkt aanpassing.

- Verantwoordelijk voor het doorgeven van genetische informatie aan nakomelingen tijdens celdeling.

- Genetisch stabiel, dient als bron van genetisch materiaal voor macronucleus.

Dit dual-nucleaire systeem biedt ciliaten met functionele compartimentering. De macronucleus ondersteunt de dagelijkse cellulaire activiteiten, terwijl de micronucleus genetische informatie bewaart en genetische diversiteit mogelijk maakt door seksuele voortplanting.