1. Inslikken: Protisten die voedsel binnenkrijgen, verslinden hun prooi in zijn geheel en gebruiken tijdelijke voedselvacuolen om het te verteren. Deze methode wordt gebruikt door amoeben, paramecia en andere ciliaten.

2. Osmose: Protisten die voedsel absorberen door osmose, nemen opgeloste voedingsstoffen op via hun celmembranen. Deze methode wordt gebruikt door sommige soorten flagellaten en dinoflagellaten.

3. Pinocytose: Pinocytose is een proces waarbij protisten vloeistoffen en opgeloste stoffen opnemen door kleine zakjes in hun celmembranen te vormen. Deze methode wordt gebruikt door sommige soorten amoeben en ciliaten.