science >> Wetenschap >  >> Biologie

Epigenetica: definitie, hoe het werkt, voorbeelden

De genetische informatie voor een organisme is gecodeerd in het DNA van de chromosomen van het organisme, maar er zijn andere invloeden op het werk. De DNA-sequenties waaruit een gen bestaat, zijn mogelijk niet actief of ze zijn geblokkeerd. De eigenschappen van een organisme worden bepaald door zijn genen, maar of de genen daadwerkelijk de gecodeerde eigenschap creëren, wordt genexpressie genoemd.

Veel factoren kunnen genexpressie beïnvloeden, of het gen überhaupt of soms slechts zwak produceert . Wanneer genexpressie wordt beïnvloed door hormonen of enzymen, wordt het proces genregulatie genoemd.

Epigenetics onderzoekt de moleculaire biologie van genregulatie en de andere epigenetische invloeden
op genexpressie. In principe is elke invloed die het effect van DNA-sequenties wijzigt zonder de DNA-code te veranderen, een onderwerp voor epigenetica.
Epigenetics: definitie en overzicht

Epigenetics is het proces waardoor genetische instructies in het DNA van organismen zijn beïnvloed door niet-genetische factoren
. De primaire methode voor epigenetische processen is controle van genexpressie. Sommige controlemechanismen zijn tijdelijk, maar andere zijn permanenter en kunnen worden geërfd via epigenetische erfenis
.

Een gen drukt zich uit door een kopie van zichzelf te maken en de kopie naar de cel te sturen om te produceren het eiwit gecodeerd in zijn DNA-sequenties. Het eiwit, alleen of in combinatie met andere eiwitten, produceert een specifiek kenmerk van een organisme. Als het gen wordt geblokkeerd om het eiwit te produceren, wordt de eigenschap van het organisme niet weergegeven.

Epigenetics kijkt naar hoe het gen kan worden geblokkeerd om zijn eiwit te produceren en hoe het kan worden ingeschakeld als het wordt geblokkeerd. Onder de vele epigenetische mechanismen die de genexpressie kunnen beïnvloeden, zijn de volgende:

  • Het gen deactiveren.
  • Het gen stoppen van < em> een kopie maken
    .
  • Het gekopieerde gen stoppen van produceren van het eiwit
    .
  • De functie van het eiwit blokkeren
    .
  • Het eiwit afbreken voordat het kan werken.

    Epigenetics onderzoekt hoe genen tot expressie worden gebracht, wat hun expressie beïnvloedt en de mechanismen die genen besturen. Het kijkt naar de invloedslaag boven de genetische laag en hoe deze laag epigenetische veranderingen bepaalt in hoe een organisme eruit ziet en hoe het zich gedraagt.
    Hoe epigenetische modificatie werkt

    Hoewel alle cellen in een organisme hebben hetzelfde genoom, de cellen vervullen verschillende functies op basis van hoe ze hun genen reguleren. Op het niveau van organismen kunnen organismen dezelfde genetische code hebben, maar ze zien er anders uit en gedragen zich anders. In het geval van mensen bijvoorbeeld, hebben identieke tweelingen hetzelfde menselijke genoom, maar zullen ze er iets anders uitzien en zich gedragen, afhankelijk van epigenetische veranderingen.

    Dergelijke epigenetische effecten kunnen variëren, afhankelijk van veel interne en externe factoren, waaronder de volgende:

  • Hormonen
  • Groeifactoren
  • Neurotransmitters
  • Transcriptiefactoren
  • Chemische stimuli
  • Omgevingsprikkels


    Elk van deze factoren kunnen epigenetische factoren zijn die genexpressie in de cellen bevorderen of verstoren. Een dergelijke epigenetische controle
    is een andere manier om genexpressie te reguleren zonder de onderliggende genetische code te veranderen.

    In elk geval wordt de algemene genexpressie gewijzigd. De interne en externe factoren zijn ofwel vereist voor genexpressie, of ze kunnen een van de fasen blokkeren. Als een vereiste factor, zoals een enzym dat nodig is voor de productie van eiwitten, ontbreekt, kan het eiwit niet worden geproduceerd.

    Als er een blokkerende factor aanwezig is, kan de overeenkomstige fase van genexpressie niet werken, en de expressie van het relevante gen is geblokkeerd. Epigenetica betekent dat een eigenschap die wordt gecodeerd in de DNA-sequenties van een gen mogelijk niet in het organisme voorkomt.
    Epigenetische beperkingen voor toegang tot DNA

    Het genoom wordt gecodeerd in dunne, lange moleculen van DNA-sequenties die strak in een ingewikkelde chromatinestructuur worden gewikkeld om in kleine celkernen te passen.

    Om een gen tot expressie te brengen, wordt het DNA gekopieerd via een transcriptiemechanisme
    . Het deel van een dubbele DNA-helix dat het tot expressie te brengen gen bevat, wordt enigszins afgewikkeld en een RNA-molecuul maakt een kopie van de DNA-sequenties waaruit het gen bestaat.

    De DNA-moleculen zijn gewikkeld rond speciale eiwitten, histonen genaamd. De histonen kunnen worden gewijzigd zodat het DNA min of meer strak wordt gewikkeld.

    Dergelijke histon-aanpassingen kunnen ertoe leiden dat DNA-moleculen zo strak worden gewikkeld dat het transcriptiemechanisme, bestaande uit speciale enzymen en aminozuren, kunnen het te kopiëren gen niet bereiken. Het beperken van de toegang tot een gen door middel van histon-modificatie resulteert in epigenetische controle van het gen.
    Aanvullende epigenetische histon-modificaties

    Naast het beperken van de toegang tot genen, kunnen histone-eiwitten worden gewijzigd om meer of minder strak aan de DNA-moleculen wikkelden zich rondom hen in de chromatinestructuur. Dergelijke histon-modificaties beïnvloeden het transcriptiemechanisme waarvan de functie is om een RNA-kopie van de tot expressie te brengen genen te maken.

    Histon-modificaties die op deze manier genexpressie beïnvloeden, omvatten het volgende:

  • Methylatie - voegt een methylgroep toe aan histonen, verhoogt de binding aan DNA en vermindert genexpressie.
  • Fosforylering - voegt fosfaatgroepen toe aan histonen. Het effect op genexpressie is afhankelijk van interactie met methylatie en acetylatie.
  • Acetyleering - histonacetylering vermindert binding en reguleert genexpressie. Aan de acetylgroepen worden histonacetyltransferasen (HAT's) toegevoegd.
  • De-acetylering - verwijdert acetylgroepen, verhoogt binding en vermindert genexpressie met histondeacetylase.

    Wanneer histonen worden gewijzigd in verhoging van binding, kan de genetische code voor een specifiek gen niet worden getranscribeerd en wordt het gen niet tot expressie gebracht. Wanneer binding wordt verminderd, kunnen meer genetische kopieën worden gemaakt, of ze kunnen gemakkelijker worden gemaakt. Het specifieke gen wordt vervolgens meer en meer van het gecodeerde eiwit geproduceerd.
    RNA kan interfereren met genexpressie

    Nadat de DNA-sequenties van een gen zijn gekopieerd naar een RNA-sequentie
    , het RNA-molecuul verlaat de kern. Het eiwit dat in de genetische sequentie wordt gecodeerd, kan worden geproduceerd door kleine celfabrieken die ribosomen worden genoemd.

    De bewerkingsketen is als volgt:

    1. DNA-transcriptie naar RNA
    2. RNA-molecuul verlaat de kern
    3. RNA vindt ribosomen in de cel
    4. RNA-sequentie vertaling naar eiwitketens
    5. Eiwitproductie

      De twee sleutelfuncties van een RNA-molecuul zijn transcriptie en translatie. Naast het RNA dat wordt gebruikt om de DNA-sequenties te kopiëren en over te dragen, kunnen cellen interferentie RNA
      of iRNA
      produceren. Dit zijn korte strengen RNA-sequenties die niet-coderend RNA worden genoemd
      omdat ze geen sequenties hebben die coderen voor genen.

      Hun functie is interfereren met transcriptie en translatie, waardoor genexpressie wordt verminderd. Op deze manier heeft iRNA een epigenetisch effect.
      DNA-methylatie is een belangrijke factor in genexpressie

      Tijdens DNA-methylatie hechten enzymen die DNA-methyltransferasen worden genoemd methylgroepen aan DNA-moleculen. Om een gen te activeren en het transcriptieproces te starten, moet een eiwit zich bij het begin aan het DNA-molecuul hechten. De methylgroepen worden geplaatst op de locaties waar normaal een transcriptie-eiwit zou hechten, waardoor de transcriptiefunctie wordt geblokkeerd.

      Wanneer cellen delen, worden de DNA-sequenties van het celgenoom gekopieerd in een proces dat DNA-replicatie wordt genoemd
      . Hetzelfde proces wordt gebruikt om sperma en eicellen in hogere organismen te creëren.

      Veel van de factoren die genexpressie reguleren, gaan verloren wanneer het DNA wordt gekopieerd, maar veel van de DNA-methylatiepatronen worden in de gekopieerde gekopieerd ", 3, [[Dit betekent dat de regulatie van genexpressie veroorzaakt door DNA-methylatie kan worden geërfd
      hoewel de onderliggende DNA-sequenties onveranderd blijven.

      Omdat DNA-methylatie reageert op epigenetische factoren zoals milieu, voeding, chemicaliën , stress, vervuiling, levensstijlkeuzes en straling, de epigenetische reacties van blootstelling aan dergelijke factoren kunnen worden geërfd door DNA-methylatie. Dit betekent dat, naast genealogische invloeden, een individu wordt gevormd door het gedrag van de ouders en de omgevingsfactoren waaraan ze werden blootgesteld.
      Epigenetica Voorbeelden: Ziekten

      Cellen hebben genen die celdeling bevorderen evenals genen die snelle, ongecontroleerde celgroei onderdrukken, zoals bij tumoren. Genen die de groei van tumoren veroorzaken, worden oncogenen genoemd en die die tumoren voorkomen worden tumorsuppressorgenen genoemd.

      Menselijke kankers kunnen worden veroorzaakt door de verhoogde expressie van oncogenen in combinatie met de geblokkeerde expressie van tumorsuppressorgenen. Als het DNA-methylatiepatroon dat overeenkomt met deze genexpressie wordt geërfd, kan het nageslacht een verhoogde gevoeligheid voor kanker hebben.

      In het geval van colorectale kanker
      kan een defect DNA-methylatiepatroon worden doorgegeven door van ouders naar kinderen. Volgens een studie uit 1983 en paper van A. Feinberg en B. Vogelstein, vertoonde het DNA-methylatiepatroon van darmkankerpatiënten verhoogde methylatie en blokkering van tumor-suppressorgenen met een verminderde methylatie van oncogenen.

      Epigenetica kan ook gebruikt om genetische aandoeningen te behandelen
      . In het fragiele X-syndroom ontbreekt een X-chromosoomgen dat een belangrijk regulerend eiwit produceert. De afwezigheid van het eiwit betekent dat het BRD4-eiwit, dat intellectuele ontwikkeling remt, op een ongecontroleerde manier in overmaat wordt geproduceerd. Geneesmiddelen die de expressie van BRD4 remmen, kunnen worden gebruikt om de ziekte te behandelen.
      Epigenetica Voorbeelden: Gedrag

      Epigenetica heeft een grote invloed op de ziekte, maar het kan ook andere eigenschappen van organismen beïnvloeden, zoals gedrag.

      In een studie uit 1988 aan de McGill University merkte Michael Meany op dat ratten wiens moeders voor hen zorgden door te likken en aandacht aan hen te besteden zich ontwikkelden tot rustige volwassenen. Ratten wiens moeder ze negeerde, werden angstige volwassenen. Een analyse van hersenweefsel toonde aan dat het gedrag van de moeders veranderingen veroorzaakte in de methylatie van hersencellen
      in de babyratten. De verschillen in ratten nakomelingen waren het resultaat van epigenetische effecten.

      Andere studies hebben gekeken naar het effect van hongersnood. Toen moeders tijdens de zwangerschap werden blootgesteld aan hongersnood, zoals het geval was in Nederland in 1944 en 1945, hadden hun kinderen een hogere incidentie van obesitas en hart- en vaatziekten in vergelijking met moeders die niet werden blootgesteld aan hongersnood. De hogere risico's waren terug te voeren op verminderde DNA-methylatie van een gen dat een insuline-achtige groeifactor produceert. Dergelijke epigenetische effecten kunnen over verschillende generaties worden geërfd.

      Effecten van gedrag dat van ouders op kinderen kan worden overgedragen, kunnen het volgende omvatten:

    6. Ouder dieet kan de geestelijke gezondheid van kinderen beïnvloeden.
    7. Blootstelling aan vervuiling door ouders kan astma bij kinderen beïnvloeden.
    8. De geschiedenis van moedervoeding kan de geboortegrootte van baby's beïnvloeden.
    9. Consumptie van overtollig alcohol door de mannelijke ouder kan agressie bij nakomelingen veroorzaken.
    10. Blootstelling van ouders aan cocaïne kan het geheugen beïnvloeden.

      Deze effecten zijn het resultaat van veranderingen in DNA-methylatie die aan nakomelingen worden doorgegeven, maar als deze factoren kunnen de DNA-methylatie bij ouders veranderen, de factoren die de kinderen ervaren, kunnen hun eigen DNA-methylatie veranderen. In tegenstelling tot de genetische code kan DNA-methylatie bij kinderen worden gewijzigd door gedrag en blootstelling aan het milieu in het latere leven.

      Wanneer DNA-methylatie wordt beïnvloed door gedrag, kunnen de methylmarkeringen op DNA waar de methylgroepen zich kunnen hechten veranderen en beïnvloeden genexpressie op die manier. Hoewel veel van de onderzoeken die betrekking hebben op genexpressie dateren van vele jaren geleden, zijn de resultaten pas recenter in verband gebracht met een groeiend volume epigenetisch onderzoek
      . Dit onderzoek toont aan dat de rol van epigenetica een even grote invloed op organismen kan hebben als de onderliggende genetische code.