* Plagen en ziekten: Biologische gewassen zijn gevoeliger voor ziekten en plagen dan conventionele gewassen, omdat ze niet worden behandeld met synthetische pesticiden en herbiciden. Dit kan leiden tot lagere opbrengsten en tot hogere kosten voor biologische boeren.

* Beschikbaarheid van voedingsstoffen: Biologische gewassen kunnen lagere opbrengsten hebben dan conventionele gewassen vanwege tekorten aan voedingsstoffen. Organische bodems bevatten vaak lagere voedingsstoffen dan conventionele bodems, omdat er geen synthetische meststoffen worden gebruikt. Dit kan leiden tot lagere opbrengsten en tot hogere kosten voor biologische boeren die organische meststoffen moeten kopen.

* Beschikbaarheid van water: Biologische gewassen kunnen lagere opbrengsten hebben dan conventionele gewassen als gevolg van waterstress. Biologische gewassen hebben vaak meer water nodig dan conventionele gewassen, omdat ze niet worden behandeld met synthetische herbiciden die het waterverlies helpen verminderen. Dit kan leiden tot lagere opbrengsten en tot hogere kosten voor biologische boeren die irrigatiesystemen moeten aanschaffen.

* Concurrentie van onkruid :Onkruid kan een groot probleem zijn in de biologische landbouw, omdat biologische boeren geen synthetische herbiciden kunnen gebruiken. Dit kan leiden tot lagere opbrengsten omdat onkruid met gewassen concurreert om water, voedingsstoffen en zonlicht.

Het is echter belangrijk op te merken dat er veel variatie is in de gewasopbrengsten, en dat sommige biologische boeren opbrengsten kunnen behalen die vergelijkbaar zijn met die van conventionele boeren. Daarnaast kunnen biologische gewassen ook andere voordelen hebben, zoals een hogere voedingswaarde en een lagere impact op het milieu.