De structuur van dubbelstrengig DNA is universeel in alle levende cellen, maar er doen zich verschillen voor in de methoden voor het extraheren van genomisch DNA uit dierlijke en plantaardige cellen. Hoewel genomisch DNA in de kern van cellen leeft, hangt de hoeveelheid en zuiverheid van geëxtraheerd DNA af van het type en de grootte van de cel. Bepaalde cellen bevatten bijvoorbeeld meer DNA en onzuiverheden dan andere. Lees verder voor meer informatie over DNA-extractieverschillen.

Algemene DNA-extractie

Als u planten- en dierencellen behandelt met een zeepachtige substantie, zal het de lipiden in de cel en nucleaire membranen degraderen. Vervolgens zal het DNA-mengsel zich afscheiden van de celmembranen en eiwitten. Vervolgens kunt u alcohol gebruiken om het DNA in de oplossing te precipiteren. Afhankelijk van de hoeveelheid in het monster, kan DNA zichtbaar zijn met het blote oog. Houd er echter rekening mee dat deze eenvoudige procedure niet noodzakelijk DNA van hoge zuiverheid produceert.

Plant- en dierencellen

Plantcellen verschillen van dierlijke cellen vanwege hun stijve celwand en organellen zoals de chloroplast. Ze bevatten ook eiwitten en enzymen die een rol spelen in de fotosynthese. Sommige plantencellen hebben polyploïdie, wat betekent dat ze meer dan één kopie van elk chromosoom per cel hebben. Bovendien produceren cellulaire processen die voorkomen in planten zoals fotosynthese een reeks secundaire metabolieten. Dierlijke cellen hebben geen celwand, maar hebben nog steeds chemicaliën nodig zoals natriumdodecylsulfaat (SDS) om het celmembraan te verstoren om genomisch DNA vrij te maken.

Plantenextractie

Plantgenomisch DNA is meer moeilijk te extraheren vanwege de celwand van de plant. Je kunt het verwijderen door het te homogeniseren of door cellulase toe te voegen om de cellulose die de celwand vormt te degraderen. Bovendien kunnen de metabolieten die in de plantencel aanwezig zijn, interfereren met genomische DNA-extractie door het DNA-monster tijdens het precipitatieproces te besmetten.

Animal DNA-extractie

Perifere bloedleukocyten zijn de belangrijkste bron van dierlijke aanwezigheid genomisch DNA, maar het verzamelen van monsters is moeilijk omdat het bloed rechtstreeks van het dier moet komen. Bloed bevat een reeks verbindingen zoals eiwitten, lipiden, witte bloedcellen, rode bloedcellen, bloedplaatjes en plasma, die het DNA-monster kunnen besmetten. De primaire contaminant van dierlijk DNA dat uit bloedmonsters wordt gehaald, is heem, het niet-eiwitbestanddeel van hemoglobine.

De DNA-verschillen

De verschillen tussen DNA van planten en dieren liggen in de volgorde van basen in de helix. Verbindingen gevonden in plantencellen zijn afwezig in dierlijke cellen en DNA-basensequenties weerspiegelen dit. Ook is het DNA van de genomische plant vaak groter dan DNA van dieren. Deze verschillen hebben ook invloed op extractiemethoden, opbrengst en de zuiverheid van DNA.