* cellen: Plant, dier, bacteriële, schimmelcellen.

* Tissue: Dunne plakjes organen of andere weefsels.

* Kleine organismen: Protozoa, algen en sommige ongewervelde dieren.

* Microscopische structuren: Celorganellen, bacteriële flagella, pollenkorrels.

* kristallen: Bepaalde soorten kristallen.

* dunne vezels: Textielvezels, haar, etc.

Belangrijkste beperkingen van lichtmicroscopen:

* Beperkte resolutie: Ze kunnen objecten niet kleiner zien dan ongeveer 200 nanometers.

* Vereiste voor dunne monsters: Licht moet door het te bekijken monster gaan.

* Beperkte velddiepte: Slechts een klein deel van het exemplaar staat tegelijkertijd in focus.

Ondanks deze beperkingen zijn lichtmicroscopen ongelooflijk waardevolle hulpmiddelen in onderzoek, geneeskunde en onderwijs vanwege hun toegankelijkheid, betaalbaarheid en het vermogen om een breed scala aan biologische structuren te visualiseren.