Zoetwaterbiomen vormen slechts één procent van het aardoppervlak, maar ze bieden een thuis voor een onevenredig groot aantal soorten ter wereld. Het ecosysteem van een zoetwatermeer of rivier kan echter extreem kwetsbaar zijn en menselijke activiteiten kunnen op een aantal manieren schadelijk zijn voor hun gezondheid: zoals het ontwikkelen van structuren, het omleiden van hun stroom, het vervuilen en het leegpompen van hulpbronnen. In veel opzichten zijn mensen afhankelijk van zoetwaterecosystemen om te overleven, maar hun impact op deze waterwegen kan verwoestend zijn.

TL; DR (te lang; niet gelezen)

Afleiding, overmatig gebruik, en vervuiling dragen allemaal bij aan de manier waarop de mens zoetwatersystemen schade toebrengt.
Habitatverandering door industrie

Mensen kunnen zoetwaterecosystemen veranderen of zelfs vernietigen door de bouw van hydro-elektrische dammen of irrigatieprojecten. Dammen creëren waterreservoirs en beperken de stroom water stroomafwaarts van het project kunstmatig, wat het ecosysteem aan beide zijden van de constructie aanzienlijk kan veranderen. Op dezelfde manier kan het omleiden van water voor irrigatie ook het beschikbare water voor de dieren in het gebied verminderen en de natuurlijke waterstroom door de watervoerende laag veranderen. Na verloop van tijd kunnen deze veranderingen leiden tot de ontwikkeling van nieuwe ecosystemen in de getroffen gebieden, maar zware verstoringen van het natuurlijke evenwicht leiden tot ernstige bijwerkingen.
Overmatig gebruik van water

Mensen kunnen een grote invloed hebben op zoetwatersystemen door overmatig watergebruik. Dezelfde waterwegen die dieren en planten ondersteunen, leveren ook gemeentelijk water voor steden en dorpen, en wanneer consumptie de natuurlijke regeneratie van deze waterwegen overtreft, kan dit het ecosysteem negatief beïnvloeden. Het verminderen van de hoeveelheid water in meren en andere reservoirs oefent druk uit op waterpopulaties, waardoor de hoeveelheid beschikbare leefruimte wordt verminderd en in sommige gevallen droogt het beken en vijvers volledig op.
Chemische afvoer en vervuiling

Zoetwaterecosystemen in de buurt van dorpen en steden worden ook bedreigd door afvoer en vervuiling. Industriële dumping, deeltjesvervuiling door verbrandingsmotoren en landbouwmeststoffen en pesticiden komen in veel gevallen terecht in rivieren en beken, die daar rechtstreeks vallen of door regen naar de waterwegen worden vervoerd. Vooral giftige verontreinigende stoffen kunnen een ecosysteem volledig tenietdoen, maar zelfs kleine hoeveelheden minder dodelijke stoffen kunnen een effect hebben op dieren in het wild. Sommige van deze giftige stoffen kunnen zelfs genetische mutaties veroorzaken, de levenscyclus van vissen, amfibieën en andere dieren in het wild veranderen en geboorteafwijkingen veroorzaken die een populatie in de loop van de tijd kunnen vernietigen.
Afvalwaterafval en andere ongelukken

Terwijl gemeentelijke rioolwaterzuiveringsinstallaties en veehouderijen brengen alleen behandeld water onder normale omstandigheden in het milieu vrij, systeemstoringen en overstromingen kunnen leiden tot een lozing van onbehandeld rioolwater in de watercyclus. Afhankelijk van de specifieke giftigheid van de lekkage, kan het grote aantallen dieren in het wild doden, of het kan alleen de voedingsstoffenbalans in het water veranderen. Deze onbalans kan algenbloei veroorzaken, die een zoetwaterecosysteem kan verstikken door alle beschikbare zuurstof op te nemen of zelfs de ontwikkeling van toxische organismen, inclusief bepaalde soorten cyanobacteriën, die dodelijk kunnen zijn voor dieren in het wild en zelfs mensen kunnen beïnvloeden, te stimuleren.