- Verminderde basisstroom: De grondwaterafvoer levert een belangrijke bijdrage aan de basisafvoer, het deel van de stroom dat in droge perioden in stand blijft. Wanneer het oppompen van grondwater de natuurlijke aanvullingssnelheid overschrijdt, kan dit leiden tot een daling van de grondwaterstanden en een vermindering van de basisafvoer. Dit kan aanzienlijke ecologische gevolgen hebben, aangezien basisstroming essentieel is voor het behoud van aquatische habitats tijdens droogtes.

- Verhoogde flitsende stromen: Het pompen van grondwater kan ook de timing van de stroomstroming veranderen. Wanneer de grondwaterstanden worden verlaagd, zakt de grondwaterspiegel onder de stroombedding, waardoor een verticale gradiënt ontstaat waardoor water snel in de grond kan infiltreren. Dit kan resulteren in verhoogde flitsende stromingen, waarbij de stroming snel stijgt en daalt als reactie op regenval. Flitsende stromingen kunnen kanaalerosie veroorzaken, de infrastructuur beschadigen en aquatische ecosystemen verstoren.

- Veranderingen in de waterkwaliteit: Het pompen van grondwater kan ook de kwaliteit van de stroom beïnvloeden. Wanneer de grondwaterstanden worden verlaagd, kan het water dat de stroom binnenkomt van slechtere kwaliteit zijn, omdat het hogere concentraties verontreinigende stoffen zoals nitraten, pesticiden en zware metalen kan bevatten. Dit kan schadelijke gevolgen hebben voor het waterleven en de menselijke gezondheid.

- Verlies van leefgebied: Het oppompen van grondwater kan ook leiden tot het verlies van waterhabitat. Als het grondwaterpeil daalt, kan dit ervoor zorgen dat bronnen en moerassen opdrogen, essentiële leefgebieden voor veel planten- en diersoorten. Het verlies van deze habitats kan de voedselketens verstoren en grote gevolgen hebben voor het hele ecosysteem.