Isomerisatie van alkanen met rechte keten verlaagt niet noodzakelijkerwijs hun kooktemperatuur. In feite heeft het vaak het tegenovergestelde effect:het verhoogt het kookpunt.

Sommige isomeren, waaronder vertakte alkanen, kunnen echter lagere kookpunten hebben in vergelijking met hun tegenhangers met rechte keten als gevolg van verschillen in moleculaire structuur en intermoleculaire krachten. Vertakte alkanen hebben een compactere vorm en zwakkere intermoleculaire krachten, wat leidt tot lagere kookpunten dan alkanen met een rechte keten met een vergelijkbaar molecuulgewicht.