Een buffer is een chemische stof die helpt bij het handhaven van een relatief constante pH in een oplossing, zelfs bij toevoeging van zuren of basen. Buffering is belangrijk in levende systemen als middel om een redelijk constante interne omgeving te handhaven, ook bekend als homeostase. Kleine moleculen zoals bicarbonaat en fosfaat bieden buffercapaciteit net als andere stoffen, zoals hemoglobine en andere eiwitten.
Bicarbonaatbuffer

Het behoud van de pH van het bloed wordt geregeld via de bicarbonaatbuffer. Dit systeem bestaat uit koolzuur- en bicarbonaat-ionen. Wanneer de pH van het bloed in het zure bereik daalt, werkt deze buffer om koolstofdioxidegas te vormen. De longen verdrijven dit gas uit het lichaam tijdens het ademhalingsproces. Tijdens alkalische omstandigheden brengt deze buffer de pH terug naar neutraal door uitscheiding van de bicarbonaat-ionen door de urine te veroorzaken.
Fosfaatbuffer

Het fosfaatbuffersysteem werkt op een manier vergelijkbaar met de bicarbonaatbuffer, maar heeft veel sterkere actie. De interne omgeving van alle cellen bevat deze buffer die waterstoffosfaationen en diwaterstoffosfaationen omvat. Onder omstandigheden wanneer overtollig waterstof de cel binnenkomt, reageert het met de waterstoffosfaationen, die deze accepteert. Onder alkalische omstandigheden accepteren de diwaterstoffosfaat-ionen de overtollige hydroxide-ionen die de cel binnendringen. De aminozuren bezitten een aminogroep en een carbonzuurgroep. Bij fysiologische pH bestaat het carbonzuur als het carboxylaation (COO) met een negatieve lading en de aminogroep bestaat als het NH <3+ ion. Wanneer de pH zuur wordt, neemt de carboxylgroep overmaat waterstofionen op om terug te keren naar de carbonzuurvorm. Als de pH van het bloed alkalisch wordt, komt er een proton vrij uit het NH ^{3+ -ion, dat de NH _{2-vorm aanneemt.
Hemoglobin Buffer}}

Het ademhalingspigment aanwezig in bloed, hemoglobine, heeft ook bufferende werking in weefsels. Het heeft het vermogen om op een bepaald tijdstip met protonen of zuurstof te binden. Binding van de ene geeft de andere vrij. In hemoglobine vindt de binding van protonen plaats in het globine-gedeelte, terwijl zuurstofbinding optreedt bij het ijzer van het heemgedeelte. Op het moment van oefening worden er teveel protonen gegenereerd. Hemoglobine helpt bij de bufferende werking door deze protonen te binden en tegelijkertijd moleculaire zuurstof vrij te geven.