science >> Wetenschap >  >> Chemie

Karakterisering van de structuur van een lid van de L-Aminozuur Transporter (LAT) familie

Structuur van de BasC-transporter. Krediet:Manuel Paladin, IRB Barcelona

In mensen, er zijn meer dan 50 soorten aminozuurtransporters, die verantwoordelijk zijn voor de cellulaire opname van aminozuren en voor het reguleren van de intra- en extracellulaire balans van deze moleculen. Mutaties in deze transporters worden in verband gebracht met een verscheidenheid aan ziekten. Echter, ondanks het belang van deze moleculen, er is weinig bekend over hoe ze werken. Wetenschappers van het Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona) hebben nu de structuur van een lid van de LAT-familie gekarakteriseerd.

LAT's vormen een familie die verschillende soorten aminozuurtransporters omvat, en zijn zelfs aanwezig in sommige soorten bacteriën. Gemuteerde LAT's worden geassocieerd met aandoeningen zo divers als autisme, leeftijdsgerelateerd gehoorverlies, cystinurie en lysinurische eiwitintolerantie.

Gepubliceerd in het tijdschrift Natuurcommunicatie , deze studie heeft zich gericht op BasC, een LAT aanwezig in bacteriën. "We hebben BasC als model gebruikt omdat het structurele en functionele gelijkenis vertoont met LAT's bij mensen, " legt Manuel Palacín uit, hoofd van het Amino Acid Transporters and Disease Lab bij IRB Barcelona.

Door de structuur en functie van BasC te analyseren, de eerste auteurs van dit werk, Ekaitz Errasti-Murugarren, Joana Fort en Paola Bartoccioni, postdoctorale fellows bij IRB Barcelona, hebben de plaats geïdentificeerd waarop aminozuren aan LAT's binden en het mechanisme dat ten grondslag ligt aan de interactie aan beide zijden van het celmembraan.

"Weten hoe LAT's de aminozuren herkennen die naar de cel moeten worden getransporteerd, stelt ons in staat hun functie beter te begrijpen en de moleculaire defecten te ontcijferen die verband houden met verschillende aandoeningen. Deze kennis zal ons vervolgens helpen om mogelijke behandelingen te ontwikkelen, " opmerkingen Palacín, professor aan de Faculteit Biologie van de Universiteit van Barcelona, en hoofd van eenheid U731 van het Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Raras (CIBERER).

In deze samenwerking tussen IRB Barcelona, CIBERER, IBMB-CSIC en het Barcelona Supercomputing Center, de onderzoekers hebben de structuur van BasC gekarakteriseerd door middel van röntgenkristallografie en met behulp van een antilichaam tegen deze transporter. "De BasC-antilichamen die we hebben ontwikkeld, bieden een uitstekend hulpmiddel om de functie van deze transporter te bestuderen, ", voegt Palacin toe.

Structuur van de BasC-transporter. Krediet:Manuel Palacin, IRB Barcelona