In een groot multidisciplinair project onderzoekers van Karolinska Institutet hebben verschillende eigenschappen onderzocht van een enzymfamilie genaamd NUDIX-hydrolasen. De studie, gepubliceerd in Natuurcommunicatie , onthult nieuwe inzichten in hun biologische functies in menselijke cellen.

De NUDIX-enzymen zijn betrokken bij verschillende belangrijke cellulaire processen zoals cellulair metabolisme, homeostase en mRNA-verwerking. Hoewel sterk geconserveerd in alle organismen, hun individuele structurele, biochemische en biologische eigenschappen blijven grotendeels onduidelijk.

Dit behandelen, Professor Thomas Helleday en assistent-professor Jordi Carreras-Puigvert van het Karolinska Institutet's Department of Medical Biochemistry and Biophysics and Science for Life Laboratory (SciLifeLab) startten een samenwerkingsstudie met onderzoekers van de Universiteit van Uppsala, Universiteit van Stockholm, de Universiteit van Ljubljana in Slovenië, en leden van de Human Protein Atlas.

Uitgebreide enzymprofielkaart

De samenwerking heeft geleid tot uitgebreide gegevens over individuele eigenschappen en onderlinge relaties van 18 menselijke NUDIX-enzymen, onthullende vier belangrijke structurele klassen. Met behulp van een nieuw algoritme, de onderzoekers integreerden alle gegevens en creëerden een uitgebreide NUDIX-enzymprofielkaart.

"Deze kaart onthult nieuwe inzichten in substraatselectiviteit en biologische functies van NUDIX-hydrolasen en vormt een platform voor het uitbreiden van hun gebruik als biomarkers en potentiële nieuwe doelwitten voor kankergeneesmiddelen", zegt Jordi Carreras-Puigvert.

Het multidisciplinaire project omvatte analyses in de biochemie, structurele biologie, functionele genomica, genexpressie, eiwitexpressie en bio-informatica.