Science >> Wetenschap & Ontdekkingen >  >> Biologie

Waarom werken enzymen meestal slechts op één substraat (of groep nauw verwante substraten)?

Enzymen zijn zeer specifieke katalysatoren, wat betekent dat ze meestal slechts één of een zeer beperkt aantal reacties met specifieke substraten katalyseren. Deze specificiteit komt voort uit verschillende belangrijke factoren:

1. Vorm en structuur:

* Actieve site: Enzymen hebben een unieke driedimensionale vorm en in deze vorm bezitten ze een specifiek gebied dat de actieve site wordt genoemd. De actieve plaats is waar het substraat bindt en de gekatalyseerde reactie ondergaat.

* Lock-and-Key-model: De vorm van de actieve plaats is complementair aan de vorm van het substraat, net als een slot en sleutel. Met deze precieze pasvorm kan het enzym zijn specifieke substraat herkennen en binden, met uitzondering van andere moleculen.

2. Chemische interacties:

* Niet-covalente bindingen: De actieve plaats bevat ook specifieke aminozuurresiduen die niet-covalente bindingen vormen met het substraat, zoals waterstofbruggen, ionische interacties en van der Waals-krachten. Deze interacties dragen verder bij aan de specificiteit van het enzym.

* geïnduceerde pasvorm: In sommige gevallen kan de actieve plaats van het enzym zijn vorm bij substraatbinding enigszins veranderen, waardoor de pasvorm verder wordt verbeterd en de reactie wordt vergemakkelijkt.

3. Evolutionaire selectie:

* specificiteit is gunstig: Specificiteit is voordelig voor organismen omdat het sterk gecontroleerde en efficiënte metabole paden mogelijk maakt. Enzymen zijn als gespecialiseerde werknemers in de cel, die elk een specifieke taak uitvoeren.

* evolutionaire druk: Na verloop van tijd zijn enzymen geëvolueerd om te interageren met specifieke substraten vanwege selectieve druk die de voorkeur geven aan die met de hoogste efficiëntie en precisie.

4. Groepsspecificiteit:

* Vergelijkbare structuren: Sommige enzymen vertonen de specificiteit van de groep, wat betekent dat ze kunnen werken op een groep nauw verwante substraten die vergelijkbare structurele kenmerken delen. Dit komt omdat ze vergelijkbare bindingsplaatsen en chemische eigenschappen delen.

Voorbeelden:

* lactase: Dit enzym breekt specifiek lactose af, een disaccharide in melk. Het heeft een hoge affiniteit voor lactose en zal niet communiceren met andere suikers.

* pepsin: Dit enzym verteert eiwitten in de maag. De actieve locatie kan binden aan verschillende peptidebindingen, maar geeft er de voorkeur aan om specifieke af te breken, wat bijdraagt aan de selectieve afbraak van eiwitten.

Uitzonderingen:

Hoewel de meeste enzymen een hoge specificiteit vertonen, zijn er enkele uitzonderingen. Sommige enzymen kunnen bijvoorbeeld op een breder scala van substraten werken, en andere kunnen worden beïnvloed door omgevingsfactoren zoals pH of temperatuur, die hun specificiteit kunnen beïnvloeden.

Samenvattend is de enzymspecificiteit een resultaat van hun unieke vorm, actieve plaatsstructuur en chemische interacties met hun substraten, waardoor ze specifieke reacties kunnen katalyseren met veel efficiëntie en controle in cellen.