De term "archaebacteriën" is verouderd. Het wordt niet langer beschouwd als een geldig taxonomisch koninkrijk. De organismen die ooit zijn geclassificeerd als archaebacteriën, worden nu geclassificeerd als archaea , een afzonderlijk levensdomein naast bacteriën en Eukarya.

Hier zijn enkele voorbeelden van organismen die behoren tot de domein archaea:

extremofielen:

* halofielen: Deze archaea gedijen in extreem zoute omgevingen, zoals de Dode Zee of Salt Flats. Voorbeelden zijn *Halobacterium salinarum *.

* thermofielen: Deze Archaea zijn dol op hete omgevingen, zoals warmwaterbronnen of hydrothermische ventilatieopeningen. Voorbeelden zijn *Pyrococcus furiosus *en *thermococcus litoralis *.

* acidofielen: Deze archaea overleven in zure omgevingen, zoals vulkanische warmwaterbronnen. Voorbeelden zijn *sulfolobus acidocaldarius *.

* methanogenen: Deze archaea produceren methaangas als bijproduct van hun metabolisme. Ze worden gevonden in verschillende omgevingen, waaronder moerassen, rioolwaterzuiveringsinstallaties en het lef van dieren. Voorbeelden zijn *methanobacterium thermoautotroficum *.

Andere archaea:

* nanoarchaeota: Dit zijn extreem kleine archaea, met het kleinste bekende genoom van elk vrijlevend organisme. * Nanoarchaeum Equitans* is een goed bestudeerd voorbeeld.

* Thaumarchaeota: Deze komen vaak voor in oceaanwateren en bodem en spelen een belangrijke rol bij stikstofcycli.

Het is belangrijk op te merken dat er veel meer soorten archaea zijn buiten deze voorbeelden. Nieuwe soorten worden constant ontdekt en de diversiteit van dit domein is enorm en nog steeds niet volledig begrepen.