Dit is waarom:

* Prokaryoten zijn eenvoudige cellen: Ze missen de complexe interne organisatie die wordt gevonden in eukaryotische cellen.

* DNA is vrij zweven: Hun genetisch materiaal (DNA) bevindt zich in een gebied genaamd de nucleoid , die niet wordt omsloten door een membraan. Dit betekent dat het niet van de rest van de cel wordt gescheiden door een afzonderlijke nucleaire envelop.

* Geen membraangebonden organellen: Prokaryoten missen ook andere membraangebonden organellen die eukaryotische cellen hebben, zoals mitochondriën, endoplasmatisch reticulum en Golgi-apparaat.

daarentegen hebben eukaryotische cellen een echte nucleus waarbij hun DNA is opgenomen en gescheiden van het cytoplasma door een nucleair membraan.