Alle levensvormen die de mensheid kent, behoren tot een zogenaamd 'koninkrijk', maar het is niet altijd gemakkelijk om te weten waarom een levensvorm tot een bepaald koninkrijk behoort en niet tot een ander. Kingdoms Protista en Monera bevatten beide eencellige levensvormen, maar ze onderscheiden zich van elkaar.
Nucleus

Een groot verschil tussen monerans en protisten ligt in de kern, het "commandocentrum" van een cel. Moneranen hebben geen echte kern, terwijl protisten kernen gebonden hebben in hun eigen kernmembranen. Wetenschappers classificeren organismen met echte kernen als eukaryoten en organismen zonder hen als prokaryoten.
Complexiteit

Naast het opnemen van een echte kern, zijn protisten organisatorisch complexer dan monerans. Protisten vertonen kenmerken die organellen worden genoemd, die verschillende taken in de cel hebben en zichtbare bewegingsmethoden kunnen vertonen. Monerans hebben dit soort functies niet.
Grootte

De maten van verschillende soorten binnen elk koninkrijk variëren, maar protisten zijn over het algemeen groter dan monerans. Protisten zijn soms zelfs zichtbaar met alleen een vergrootglas. Monerans zijn meestal veel kleiner dan dat. Blauwgroene bacteriën, die tot monera behoren, zijn echter groter.