science >> Wetenschap >  >> Biologie

De diversiteit aan gewassen ter wereld documenteren en beschikbaar maken

EURISCO documenteert gewasdiversiteit, waaronder verschillende soorten gerst, afgebeeld. Krediet:Nora Capozio

Genenbanken spelen een belangrijke rol bij de instandhouding op lange termijn van plantgenetische hulpbronnen voor voedsel en landbouw. Van de 1.800 genenbankcollecties wereldwijd zijn er meer dan 600 in Europa. Deze enorme diversiteit aan gewassen kan worden benut om onze gewassen voedzamer, productiever en veerkrachtiger te maken tegen plagen, ziekten en veranderingen in het milieu, alleen als we er informatie over hebben.

De European Search Catalogue for Plant Genetic Resources (EURISCO) is een internationale geaggregeerde database die een centraal toegangspunt biedt voor informatie over de grote genetische diversiteit van gewassen die bewaard is gebleven in meer dan 400 instituten in 43 Europese en aangrenzende landen.

Een update over EURISCO is onlangs gepubliceerd in het Nucleic Acids Research (NAR) speciale uitgave over biologische databases.

Momenteel zijn in EURISCO meer dan 2 miljoen toetredingen tot plantgenetische hulpbronnen gedocumenteerd, bestaande uit 6.737 geslachten en 45.175 soorten. Deze omvatten belangrijke granen zoals tarwe en maïs, peulvruchten zoals bonen, erwten en wikke, eetbare oliehoudende zaden zoals zonnebloem en lijnzaad, knolgewassen zoals aardappelen en Brassica-gewassen.

Meer dan 400.000 toetredingen maken deel uit van het Multilateral System of Access and Benefit Sharing (MLS) van het International Treaty on Plant Genetic Resources for Food and Agriculture (ITPGRFA), wat betekent dat ze door de respectieve landen zijn bevestigd om onmiddellijk beschikbaar te zijn onder standaard en internationaal overeengekomen voorwaarden voor het delen van voordelen. Daarnaast zijn er 2,6 miljoen records met fenotypische gegevens van meer dan 3.800 experimenten die zijn uitgevoerd op genenbankmateriaal.

Sinds de eerste publicatie in de NAR Database Issue in 2017 is de hoeveelheid gegevens in EURISCO voortdurend gegroeid:het aantal instellingen voor gegevensaanbieders steeg van 376 naar 402, het aantal gedocumenteerde toetredingen steeg met meer dan 200.000 en het aantal fenotypische datapunten stegen met 2,2 miljoen (500%).

"Dit toont aan dat EURISCO gestaag wordt geaccepteerd als opslagplaats van dergelijke gegevens", zegt Stephan Weise, EURISCO-coördinator. "Bovendien worden de gegevens over plantgenetische bronnen voortdurend onderhouden en uitgebreid door de gegevensleveranciers. Elk jaar worden tussen de 30 en 40 National Inventory-datasets bijgewerkt in EURISCO, voor gemiddeld 350.000-400.000 toetredingen per jaar. Met de Europese Coöperatie Programma voor Plant Genetic Resources (ECPGR), we organiseren trainingsworkshops om gegevensleveranciers te ondersteunen en uiteindelijk de gegevenskwaliteit te verbeteren."

Begin 2022 werd de gebruikersinterface van EURISCO volledig herzien en omvat een gecombineerde zoekopdracht via paspoort- en fenotypische gegevens, facetzoeken, op kaarten gebaseerde selectieopties van toetredingen en zoekindexen voor wetenschappelijke namen en gangbare gewasnamen.

In 2023 zal EURISCO ook een uitbreiding uitvoeren om gegevens op te nemen over in-situ populaties van wilde verwanten van gewassen, die een belangrijke bron zijn voor programma's voor gewasverbetering.

"EURISCO is een hoeksteen van het Europese informatiesysteem voor plantgenetische hulpbronnen, en de verdere ontwikkeling en versterking ervan zijn belangrijke doelen van de strategie voor plantgenetische hulpbronnen voor Europa", concludeerde Lorenzo Maggioni, ECPGR-secretaris. + Verder verkennen

Nieuwe kennis in de geschiedenis:evaluatie van zeven decennia ex situ zaadregeneratie