Schimmels en algen worden vaak verward en onderling uitwisselbaar besproken. Inderdaad, het bemoste korstmos dat vaak op rotsen en bomen wordt gevonden, is eigenlijk een combinatie van schimmel en een vorm van algen; schimmels en algen zijn in de meeste opzichten echter behoorlijk verschillend. Hoewel algen bijvoorbeeld lid zijn van het protista-koninkrijk, zijn schimmels lid van het plantenrijk. Bovendien missen algen, in tegenstelling tot veel schimmels, elke vorm van wortels of stengels. Ondanks de significante verschillen zijn er toch enkele overeenkomsten tussen schimmels en algen.
Veel soorten

Eén ding dat algen en schimmels gemeen hebben, is dat deze twee termen een grote verscheidenheid aan soorten omvatten. Schimmels omvatten bijvoorbeeld niet alleen de paddestoelen en grotere schimmels waar veel mensen bekend mee zijn, maar ook microscopische variëteiten, zoals gist. Deze variëteiten bestaan over bijna elk ecosysteem op aarde.

Evenzo variëren algen ook van microscopische organismen, zoals eencellige organismen, tot enorme kelp, die wel 65 meter lang kan worden. Volgens het Smithsonian National Museum of Natural History zijn er bijna 300.000 exemplaren in de Amerikaanse algencollectie. Net zoals schimmels geografisch wijd verspreid zijn, kunnen algensoorten ook over de hele wereld worden gevonden in een verscheidenheid van omgevingen, waaronder enkele van de meest extreme omgevingen op aarde.
Vochtige omgevingen

Schimmels en algen verkiezen beide "live in moist environments.", 3, [[Een van de voordelen van algen vanwege hun symbiotische korstmosrelatie met schimmels is hun vermogen om te overleven op land in een vochtige omgeving.

Hoewel schimmels liever een vochtige omgeving hebben, kunnen schimmelsoorten worden gevonden in bijna elke omgeving, inclusief woestijnen.

Algen hebben meestal meer vocht nodig dan schimmels om te overleven. De meeste algen komen inderdaad voor in aquatische omgevingen, zoals meren en oceanen, hoewel ze ook in terrestrische omgevingen kunnen worden gevonden.
Haploid Nuclei

Zowel schimmels als algen zijn in het algemeen voorbeelden van organismen die een haploïde kernen bezitten. Dit betekent dat ze slechts één kopie van elk chromosoom hebben. Diploïde organismen, zoals mensen en de meeste zoogdieren, hebben daarentegen twee exemplaren van elk chromosoom.