Het leven is tot bloei gekomen in de Costa Ricaanse regenwouden en mariene milieus (een op de 20 van alle planten- en diersoorten is te vinden in Costa Rica), maar er zijn ook meer dan 100 soorten op de Internationale Unie voor het behoud van de natuur en Natuurlijke hulpbronnen lijst van bedreigde soorten. Ontbossing, habitatconversie en vervuiling zijn de boosdoeners achter de verzwakking van veel soorten.

Zoogdieren

Costa Rica heeft een van de rijkste populaties vleermuizen ter wereld, die bestaat uit de helft van de populatie zoogdieren. Vleermuissoorten op de lijst variëren van de grote roofzuchtige spectrale vleermuis tot de Hondurese witte vleermuis, slechts ongeveer 37 tot 47 mm lang, hoewel beide een laag risico hebben. Katachtigen zoals de kleine gevlekte kat, de Costa Ricaanse poema en de jaguar uit Midden-Amerika zijn verjaagd uit hun leefgebieden en cottontop tamarin, mantelrog en de spinnenapprimaten van Geoffroy zijn sterk verminderd. Andere bedreigde zoogdieren zijn de reuzen miereneter, Sambar-herten en de tapir van Baird.

Vogels

Costa Rica is de thuisbasis van 894 soorten vogels, meer dan in de Verenigde Staten en Canada samen. Hiervan zijn meer dan 600 permanente bewoners, waaronder de bedreigde blote nekparapluvogel, zwarte guan en blauw-en-goud-tanager, maar vogels zoals de cerulean-grasmus en de elegante stern zijn trekvogels. De Cocos-eilandvink verblijft op het Cocos-eiland 360 mijl voor de kust van Costa Rica. Het is de enige van Darwins vinken die niet volledig endemisch zijn voor de Galápagos. Andere bedreigde vogelsoorten zijn bekende soorten zoals de adelaar (zwarte eenzame arend), ara (grote groene ara), kolibrie (mangrovekolibrie) en papegaai (papegaai met rode voorkant).

Reptielen en amfibieën

De vijfkolige stekelstaart leguaan en smal overbrugde modder schildpad zijn enkele van de reptielen die in gevaar zijn, maar er zijn veel meer bedreigde amfibieën, waarvan de meeste kikkers of salamanders zijn die meestal worden gerepresenteerd door grote diversiteit in regenwoudomgevingen . De maki-bladkikker en de boomkikker van Starrett worden vermeld als ernstig bedreigd. Dat geldt ook voor El Empalme-wormsalamander en twee soorten padden: de pico blanco-pad en pass-stubfoot-pad. De gouden pad van Monte Verde is sinds 1989 niet meer gezien en wordt als uitgestorven beschouwd.

Vis en zeevruchten

De meeste Costa Ricaanse vissen op de lijst van bedreigde soorten zijn bijna bedreigd of kwetsbaar. Deze omvatten de olijven tandbaars, Pacific zeepaard en kroonhaai. Een aantal stralen staan ​​ook op de lijst, zoals de bullseye elektrische straal in de Stille Oceaan en de cownose straal in de Atlantische Oceaan.

Ongewervelde dieren

Er zijn een aantal bedreigde schaduwdamsels, insecten die lijkt op libellen. Deze omvatten soorten met een zwarte rug, langwerpige chiriquita, cacao en reventazon. Veel van de andere bedreigde insecten zijn knobtailed libellen zoals de limon, humped, catago, vulkaan, alajuela en gehoornde soorten. Twee soorten zoetwaterkrabben en verschillende zeekoralen maakten ook de IUCN-lijst.

Planten

Er zijn meer dan 9.000 bekende plantensoorten in Costa Rica. Bedreigde planten omvatten leden van de vlinderbloemigenfamilie zoals abarema en de lancepod, waarvan de laatste zijn naam ontleent aan zijn lansachtige vrucht. Er zijn ook 24 soorten van de eugenia van de bloeiende plant, negen soorten van de aromatische plant quararibea en twee soorten van het geslacht virola, die nauw verwant is aan de nootmuskaat en gele bloemen heeft met een penetrante geur. Andere grote bedreigde geslachten zijn de coralberry, de fan palm cryosophila en de groenblijvende of droge seizoen loofboom cedrela. De Costa Ricaanse jatropha, manilkara-boom en gavilán blanco-boom zijn specifiek bedreigde plantensoorten.