Science >> Wetenschap & Ontdekkingen >  >> Biologie

Wat is een phylotype?

A phylotype is een taxonomische eenheid gedefinieerd door moleculaire gegevens , specifiek DNA -sequenties. Het is een manier om organismen te groeperen op basis van hun genetische overeenkomsten, vaak gericht op specifieke genen zoals het 16S rRNA -gen in bacteriën.

Hier is een uitsplitsing van wat een phylotype maakt:

* Gebaseerd op DNA -sequenties: Fylotypes worden gedefinieerd door de unieke sequenties van een specifiek gen of genetisch gebied, meestal met een specifieke drempel voor hoe vergelijkbaar de sequenties moeten worden beschouwd als hetzelfde phylotype.

* Niet noodzakelijk een soort: Een phylotype kan overeenkomen met een bekende soort, maar het kan ook een groep nauw verwante organismen vertegenwoordigen die niet formeel als soort zijn geclassificeerd.

* nuttig voor het bestuderen van microbiële gemeenschappen: Phylotypes zijn vooral belangrijk bij het bestuderen van microbiële gemeenschappen, waar traditionele taxonomische methoden vaak moeilijk of onmogelijk zijn om toe te passen vanwege de enorme diversiteit van micro -organismen.

Hier zijn enkele belangrijke punten over phylotypes:

* Het zijn operationele taxonomische eenheden (OTUS): Phylotypes worden vaak door elkaar gebruikt met de term "operationele taxonomische eenheid" (OTU), die verwijst naar elke groep organismen die worden beschouwd als een afzonderlijke eenheid voor analyse.

* Ze kunnen worden gedefinieerd op verschillende taxonomische niveaus: Een phylotype kan een soort, een geslacht of een meer specifieke taxonomische groep vertegenwoordigen, afhankelijk van het gekozen gen en de sequentie -gelijkenisdrempel.

* ze zijn dynamisch: Phylotype -definities kunnen worden herzien naarmate er meer sequentiegegevens beschikbaar komen en ons begrip van microbiële diversiteit evolueert.

Samenvattend: Phylotypes zijn een krachtig hulpmiddel voor het begrijpen van microbiële diversiteit en evolutie. Ze stellen onderzoekers in staat om organismen te groeperen op basis van hun genetische relaties, zelfs wanneer traditionele taxonomische methoden niet haalbaar zijn. Dit is vooral belangrijk in de studie van microbiële gemeenschappen, waar het identificeren en classificeren van individuele soorten een uitdaging kan zijn.