Dit is waarom:

* Gebrek aan een kern: Prokaryoten hebben geen membraangebonden kern, terwijl eukaryoten dat doen. Bacillus anthracis heeft zijn genetische materiaal (DNA) in een gebied dat de nucleoid wordt genoemd, maar het is niet ingesloten in een membraan.

* Gebrek aan membraangebonden organellen: Prokaryoten missen andere membraangebonden organellen zoals mitochondriën, Golgi-apparaat en endoplasmatisch reticulum, die aanwezig zijn in eukaryoten. Bacillus anthracis heeft eenvoudiger interne structuren.

* kleiner formaat: Prokaryoten zijn over het algemeen veel kleiner dan eukaryoten. Bacillus anthracis is een staafvormige bacterie, meestal ongeveer 1-10 micrometer lang, die binnen het typische groottebereik voor prokaryoten valt.

Daarom classificeert de afwezigheid van een kern en andere membraangebonden organellen Bacillus anthracis als een prokaryote.