Terwijl DNA dubbelstrengs is, is RNA enkelstrengs. Dit betekent dat er maar één keten van nucleotiden aan elkaar is gekoppeld.

Het is echter belangrijk op te merken dat RNA soms op zichzelf kan worden teruggevouwen en complexe driedimensionale structuren kan vormen. Deze vouwing is te wijten aan het combineren van complementaire basen in de enkele streng, vergelijkbaar met hoe DNA -strengen paren.