* De levensboom is complex: Ons begrip van de evolutionaire relaties tussen bacteriën evolueert voortdurend. De levensboom is complex en er is lopend onderzoek om de exacte relaties tussen verschillende bacteriële lijnen te bepalen.

* geen "ontbrekende link": In tegenstelling tot de zoektocht naar een ontbrekende link tussen mensen en apen, is er niet één enkel organisme dat definitief het startpunt van alle bacteriën vertegenwoordigt. Evolutie is een geleidelijk proces, en de meest primitieve bacteriën bestonden waarschijnlijk lang geleden en zijn er vandaag niet meer.

* Horizontale genoverdracht: Bacteriën kunnen genetisch materiaal met elkaar uitwisselen, zelfs tussen verre verwante soorten. Dit proces, bekend als horizontale genoverdracht, maakt het moeilijk om het afstamming terug te traceren naar een enkele gemeenschappelijke voorouder.

Sommige groepen bacteriën worden echter beschouwd als een van de oudste en meest primitieve:

* archaea: In eerste instantie werd deze eencellige organismen beschouwd als bacteriën, maar ze zijn nu geclassificeerd als een afzonderlijk domein van het leven. Ze leven vaak in extreme omgevingen zoals hete bronnen en zoutmeren, en sommige wetenschappers geloven dat ze een vroege tak van het leven vertegenwoordigen.

* Cyanobacteria: Men denkt dat deze fotosynthetische bacteriën een sleutelrol hebben gespeeld in de evolutie van zuurstof op aarde. Er wordt aangenomen dat ze een van de oudste bekende vormen van leven zijn.

* Thermofiele bacteriën: Bacteriën die gedijen in zeer hete omgevingen worden vaak als primitief beschouwd omdat ze waarschijnlijk zijn geëvolueerd in een tijd waarin het aardoppervlak veel heter was.

Conclusie: Hoewel we de "meest primitieve" bacterie niet kunnen lokaliseren, helpt het bestuderen van deze groepen ons de vroege evolutie van het leven op aarde te begrijpen.