Chemiosmosis in chloroplasten wordt voornamelijk aangedreven door de translocatie van protonen van het thylakoïde lumen naar de stroma . Dit is het belangrijkste proces dat de protonmotieve kracht genereert die wordt gebruikt om ATP -synthese te stimuleren.

Er is echter een andere, minder belangrijke beweging van protonen die ook bijdragen aan de protongradiënt:

* Van de intermembraanruimte tot het stroma: Dit gebeurt via protonlekkanalen in het binnenste chloroplastmembraan. Deze beweging is minder efficiënt dan de primaire over het thylakoïde membraan, en de bijdrage ervan aan de protongradiënt is relatief klein.

Het is belangrijk om te onthouden dat chemiosmosis in chloroplasten voornamelijk wordt aangedreven door de protonengradiënt over het thylakoïde membraan . De beweging van protonen van de intermembraanruimte naar het stroma is een secundair proces dat in mindere mate bijdraagt.