DNA kan niet direct worden gevisualiseerd met een 400x microscoop. Dit komt omdat DNA-moleculen te klein zijn om door optische microscopen te worden opgelost. De typische grootte van een DNA-molecuul is ongeveer 2 nanometer (nm) in diameter, terwijl de resolutielimiet van een 400x microscoop ongeveer 0,25 micrometer (μm) bedraagt. Dit betekent dat objecten kleiner dan 0,25 µm niet duidelijk zichtbaar zijn met een 400x microscoop.

Om DNA zichtbaar te maken zijn speciale technieken nodig, zoals elektronenmicroscopie of atomic force microscopie. Elektronenmicroscopen gebruiken een elektronenbundel in plaats van licht, waardoor een veel hogere resolutie mogelijk is. Atoomkrachtmicroscopen gebruiken een scherpe sonde om het oppervlak van een monster te scannen, wat driedimensionale beelden van DNA-moleculen kan opleveren.