- Organische verbindingen:Bacteriën kunnen organische verbindingen gebruiken als bron van koolstof en energie. Dergelijke organische verbindingen kunnen suikers, koolhydraten, eiwitten en vetten omvatten.

- Anorganische verbindingen:Sommige bacteriën kunnen ook anorganische verbindingen gebruiken als bron van koolstof en energie. Sommige bacteriën kunnen bijvoorbeeld koolstofdioxide als koolstofbron en water als energiebron gebruiken.

- Licht:Fotosynthetische bacteriën kunnen lichtenergie gebruiken om koolstofdioxide om te zetten in organische verbindingen, een proces dat bekend staat als fotosynthese.

- Warmte:sommige bacteriën kunnen energie halen uit warmte, ook wel thermofiele bacteriën genoemd. Ze gedijen in warme omgevingen, zoals vulkanische bronnen of diepzee hydrothermale bronnen.