Watson en Crick stelden voor dat de twee strengen van de dubbele helix bij elkaar worden gehouden door waterstofbruggen tussen complementaire basenparen. Ze suggereerden echter ten onrechte dat adenine (A) paren met thymine (T) en guanine (G) paren met cytosine (C).

Deze fout werd snel gecorrigeerd, omdat experimenteel bewijs aantoonde dat A daadwerkelijk paren met T en G paren met C. Deze paring staat bekend als complementaire basenparing en is essentieel voor het handhaven van de structurele stabiliteit van DNA.

Samenvattend was de fout in het DNA-modelpapier van Watson-Crick de onjuiste paring van basenparen. Hoewel deze fout significant was, werd deze snel gecorrigeerd en deed niets af aan het belang van de algehele bijdrage van het artikel aan ons begrip van de DNA-structuur.