Wetenschappers hebben een nieuwe techniek ontwikkeld waarmee ze kortlevende RNA-moleculen kunnen vangen en bestuderen, wat nieuwe inzichten oplevert in hoe gentranscriptie in cellen wordt gecoördineerd.

RNA-moleculen zijn essentieel voor genexpressie en fungeren als boodschappers die genetische informatie van DNA naar de eiwitproducerende machines van de cel transporteren. Sommige RNA-moleculen hebben echter een zeer korte levensduur en bestaan ​​slechts enkele seconden of minuten, waardoor ze lastig te bestuderen zijn.

De nieuwe techniek, genaamd SLAM-seq (voor Short-Lived RNA Analysis by Mate-Pair Sequencing), overwint deze uitdaging door een combinatie van chemische labeling en high-throughput sequencing te gebruiken om kortlevende RNA-moleculen vast te leggen en te identificeren.

Met behulp van SLAM-seq konden onderzoekers duizenden kortlevende RNA-moleculen in menselijke cellen identificeren en hun expressiepatronen analyseren. Ze ontdekten dat deze kortlevende RNA's betrokken zijn bij een verscheidenheid aan cellulaire processen, waaronder celgroei, differentiatie en apoptose.

De onderzoekers ontdekten ook dat de expressie van kortlevende RNA's nauw gecoördineerd is met de activiteit van RNA-polymerase II, het enzym dat DNA in RNA transcribeert. Dit suggereert dat kortlevende RNA's een belangrijke rol spelen bij het reguleren van gentranscriptie.

De nieuwe techniek biedt een krachtig hulpmiddel voor het bestuderen van de rol van kortlevende RNA's in cellulaire processen, en zou kunnen leiden tot de ontwikkeling van nieuwe therapieën voor ziekten die worden veroorzaakt door verstoringen in het RNA-metabolisme.

De studie is gepubliceerd in het tijdschrift Nature.