Neptunus had een Great Dark Spot , vergelijkbaar met de geweldige rode plek van Jupiter, die een enorme storm was die zichtbaar was in zijn atmosfeer. In tegenstelling tot Jupiter's Storm, die al eeuwenlang blijft bestaan, verdween de grote donkere plek van Neptune in 1994.

Later verscheen er een nieuwe donkere vlek op Neptunus, maar uiteindelijk verdwenen het uiteindelijk. Wetenschappers geloven dat deze donkere vlekken waarschijnlijk grote stormen zijn in de atmosfeer van Neptune.