Medewerkers van de Mayo-Illinois Alliance for Technology Based Healthcare hebben een nieuwe, single molecule test voor het detecteren van gemethyleerd DNA. Methylering - de toevoeging van een methylgroep van moleculen aan een DNA-streng - is een van de manieren waarop genexpressie wordt gereguleerd. De bevindingen verschijnen in het huidige nummer van Wetenschappelijke rapporten .

"Terwijl nanoporiën zijn bestudeerd voor genomische sequencing en screeninganalyse, deze nieuwe test kan mogelijk de noodzaak van sommige van de huidige processen bij het evalueren van epigenetica-gerelateerde ziekten omzeilen, " zegt George Vasmatzis, doctoraat, co-leider van Mayo's Biomarker Discovery Program in het Center for Individualized Medicine en co-hoofdauteur van het artikel. Hij zegt dat de test de noodzaak van bisulfietconversie van DNA kan elimineren, fluorescerende etikettering, en polymerasekettingreactie (PCR).

"De volgende stappen omvatten het verhogen van de ruimtelijke resolutie door dunnere membranen op te nemen en door dezelfde voorbereidingsstappen te integreren, " zegt Rashid Bashir, doctoraat, hoogleraar bio-engineering, directeur van het Micro- en Nanotechnologielaboratorium, en co-hoofdauteur van de studie aan de Universiteit van Illinois in Urbana-Champaign.

een nanoporie, in dit geval, is een heel klein gaatje in een kunstmatig membraan, waardoor slechts een enkel molecuul kan worden gelokaliseerd en geïdentificeerd. Onderzoekers zeggen dat dit nuttig is omdat methylering in promotorsequenties tumorontwikkeling bij de meeste belangrijke soorten kanker kan aangeven en mogelijk een betere biomarker is dan veel genetische markers. Wetenschappers zijn nu in staat om gemethyleerd van niet-gemethyleerd DNA te onderscheiden door een eiwit te hechten aan de gemethyleerde nucleotiden die ionische elektrische stroom meten via een nanoporie in vaste toestand.